More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  68.46 
 
 		 889 aa  1077    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1715    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  62.3 
 
 		 858 aa  943    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  56.32 
 
 		 1839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  55.7 
 
 		 1403 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  52.98 
 
 		 1168 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  59.36 
 
 		 998 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  56.62 
 
 		 998 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  52.71 
 
 		 856 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  53.69 
 
 		 874 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  34.2 
 
 		 2198 aa  314  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.79 
 
 		 2807 aa  293  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  46.01 
 
 		 1610 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 		 515 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.84 
 
 		 8871 aa  251  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.09 
 
 		 1610 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1933 aa  221  5e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.27 
 
 		 2467 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 495 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1100 aa  188  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  44.09 
 
 		 340 aa  188  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.79 
 
 		 665 aa  181  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  51.26 
 
 		 553 aa  171  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  58.48 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  36.91 
 
 		 864 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.64 
 
 		 3563 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  33.59 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.57 
 
 		 1180 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  35.52 
 
 		 1280 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1027 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.77 
 
 		 1480 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  30.69 
 
 		 1991 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  29.85 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.59 
 
 		 1183 aa  100  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  28.36 
 
 		 549 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.89 
 
 		 1079 aa  94  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.55 
 
 		 1164 aa  93.2  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.63 
 
 		 1176 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.12 
 
 		 2954 aa  92.8  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 		 4334 aa  90.5  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.68 
 
 		 3598 aa  89  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.9 
 
 		 1499 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  27.81 
 
 		 2133 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.33 
 
 		 3209 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.9 
 
 		 3026 aa  84  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.14 
 
 		 855 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.73 
 
 		 1019 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  29.1 
 
 		 569 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.5 
 
 		 1197 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.09 
 
 		 5769 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.29 
 
 		 1156 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.05 
 
 		 1055 aa  81.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.32 
 
 		 820 aa  80.9  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28.71 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  26.88 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.45 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.96 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  30.86 
 
 		 503 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  33.86 
 
 		 727 aa  77.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 546 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.89 
 
 		 2836 aa  77  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 503 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1068 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  35.45 
 
 		 214 aa  75.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  30.53 
 
 		 999 aa  75.5  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 621 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.61 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  23.59 
 
 		 2245 aa  75.5  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  23.6 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  23.83 
 
 		 491 aa  73.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  48.84 
 
 		 478 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  44.68 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 437 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1176 aa  72.8  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 2107 aa  72.4  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.28 
 
 		 1279 aa  72  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.66 
 
 		 833 aa  71.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  28.66 
 
 		 1883 aa  71.6  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.06 
 
 		 2701 aa  71.2  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  30.62 
 
 		 622 aa  70.9  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.69 
 
 		 2911 aa  70.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  44.58 
 
 		 476 aa  70.1  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 		 907 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.2 
 
 		 1855 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  27.4 
 
 		 768 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.49 
 
 		 1884 aa  69.3  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  43.37 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  47.52 
 
 		 4678 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  28.27 
 
 		 1764 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  23.89 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  27.46 
 
 		 942 aa  68.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1582 aa  68.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.98 
 
 		 556 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.9 
 
 		 3954 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  29.73 
 
 		 677 aa  67  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>