228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  100 
 
 
412 aa  834    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  59.14 
 
 
421 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  58.67 
 
 
421 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  56.47 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  57.35 
 
 
421 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  55.69 
 
 
411 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  56.63 
 
 
416 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  55.28 
 
 
427 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  53.52 
 
 
427 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  52.38 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  52.38 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  52.63 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  50.98 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  52.88 
 
 
409 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  53.37 
 
 
409 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  50.24 
 
 
417 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  50.24 
 
 
410 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  50.12 
 
 
410 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  48.78 
 
 
410 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  50.63 
 
 
416 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  48.54 
 
 
421 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  49.62 
 
 
418 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  48.73 
 
 
418 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  47.39 
 
 
415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  48.62 
 
 
416 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  43.22 
 
 
433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  42.86 
 
 
433 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  47.02 
 
 
416 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  43.83 
 
 
418 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  44.74 
 
 
417 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  41.78 
 
 
433 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  42.15 
 
 
433 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  42.49 
 
 
429 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  44.5 
 
 
417 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  46.06 
 
 
416 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  46.68 
 
 
416 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  44.06 
 
 
423 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  42.04 
 
 
420 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  46.21 
 
 
416 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  46.45 
 
 
416 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  46.21 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  41.73 
 
 
420 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  43.37 
 
 
417 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  41.03 
 
 
437 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  40.74 
 
 
463 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  43 
 
 
426 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.57 
 
 
460 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  44.06 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  43.53 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  42.3 
 
 
417 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  42.68 
 
 
418 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  41.18 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  42.44 
 
 
418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  41.83 
 
 
417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  42.44 
 
 
418 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  41.35 
 
 
418 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  40.27 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  41.19 
 
 
439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  40.65 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  41.71 
 
 
408 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  40.35 
 
 
456 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  41.91 
 
 
420 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  40.33 
 
 
430 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  42.36 
 
 
408 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  41.88 
 
 
418 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  40.09 
 
 
457 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  40.05 
 
 
405 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40 
 
 
427 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  40.38 
 
 
416 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  39.14 
 
 
422 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  40.38 
 
 
422 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  40.58 
 
 
417 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  40.38 
 
 
422 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  38.72 
 
 
439 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  38.34 
 
 
443 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  40.1 
 
 
417 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.09 
 
 
423 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  40.1 
 
 
422 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  40.1 
 
 
426 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  40.55 
 
 
424 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  40.29 
 
 
423 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  38.41 
 
 
441 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  40.59 
 
 
423 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  37.95 
 
 
440 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  40.86 
 
 
428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  39.15 
 
 
442 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  41.01 
 
 
421 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  40.31 
 
 
395 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  41.1 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  39.08 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  40.85 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  39.24 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  39.03 
 
 
413 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  40.35 
 
 
430 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  38.46 
 
 
424 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  39.33 
 
 
421 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  40.05 
 
 
445 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  39.33 
 
 
421 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40.05 
 
 
440 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  39.32 
 
 
415 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>