179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49100  Nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  100 
 
 		 232 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  50.26 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  51.58 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3282  cytochrome B561  50 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00209273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  39.57 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  45.86 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  40.64 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  46.15 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  38.29 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0590  cytochrome B561  53.76 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0285  cytochrome B561  46.39 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0260456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0290  cytochrome B561  45.88 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000341868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  37.24 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  36.36 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  33.8 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  33.91 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0268  cytochrome B561  44.63 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  39.33 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  39.56 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  35.89 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0403  cytochrome B561  46.28 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  39.56 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  39.01 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  37.02 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  39.01 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1276  cytochrome B561  44.38 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.37979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  35.71 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  36.46 
 
 		 213 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  42.25 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  37.21 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  40.78 
 
 		 219 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  40.09 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  39.25 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  39.25 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  40 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2558  cytochrome B561  34.54 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.952608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  41.3 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2745  cytochrome B561  35.96 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  34.57 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  38.06 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  38.06 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  38.06 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  38.86 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  34.59 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  34.97 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  39.89 
 
 		 363 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  39.89 
 
 		 363 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  37.97 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  37.41 
 
 		 230 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  36.96 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  36 
 
 		 198 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  35.52 
 
 		 195 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  37.43 
 
 		 200 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  36 
 
 		 198 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  35.5 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  34.65 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  36.84 
 
 		 192 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  37.84 
 
 		 193 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  40.48 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  32.29 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  33.95 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  30.32 
 
 		 202 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  36.84 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  34.09 
 
 		 387 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  35.35 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  35.35 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  35.35 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  35.35 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  31.03 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  34.81 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  34.85 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  30.86 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  34.43 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  29.79 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  37.5 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  34.44 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  31.49 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  35.87 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  32.42 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  35.26 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  37.22 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  37.02 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  37.82 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  34.24 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  35.54 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  29.47 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  36.21 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1941  cytochrome b561 family protein  25.96 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00760577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2317  cytochrome B561  29.69 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0816161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  29.69 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  31.55 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2510  cytochrome B561  28.88 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  hitchhiker  0.00000518904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2726  cytochrome b, putative  28.88 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  38.8 
 
 		 182 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  37.5 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  31.84 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  32.98 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  29.38 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  29.02 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  30.05 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>