52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49090  Cytochrome C, class II  100 
 
 		 151 aa  310  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.472535  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0107  cytochrome c prime  58.45 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0327  cytochrome c, class II  51.35 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.781322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  46.9 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0569  cytochrome c, class II  48.09 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3537  cytochrome c prime  36.88 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0147332 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  39.69 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  34.03 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  33.55 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  30.94 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  34.29 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  33.57 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  31.91 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  33.07 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  32.56 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  31.93 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  32.56 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  31.91 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  29.08 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  31.91 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1123  cytochrome c prime  31.25 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000239105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2738  cytochrome c, class II  33.07 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000239572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  31.3 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  30.23 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  31.78 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  30.28 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  31.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  31.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  31.5 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  28.46 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  26.53 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  29.77 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  30.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  36.15 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1225  cytochrome c prime  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2744  cytochrome c, class II  29.14 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  31.51 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  31.13 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  29.61 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  30.88 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1325  cytochrome c, class II  27.78 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  27.46 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  27.91 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3135  cytochrome c prime  27.07 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1296  Cytochrome c556-like protein  26.17 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.618676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1455  cytochrome c, class II  29.17 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3015  cytochrome c, class II  27.61 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.628177  normal  0.504757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  27.62 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  25.93 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0112  cytochrome c prime  28.86 
 
 		 144 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0451  cytochrome c556-like protein  22.86 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  25.95 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>