267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
171 aa  341  3e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  70.83 
 
 
176 aa  246  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  76.83 
 
 
168 aa  237  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  66.67 
 
 
170 aa  234  5e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  65.48 
 
 
170 aa  232  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  64.85 
 
 
170 aa  228  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  66.47 
 
 
171 aa  228  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  66.47 
 
 
171 aa  227  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  63.91 
 
 
171 aa  221  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  76.22 
 
 
168 aa  218  4e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  63.37 
 
 
171 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  55.03 
 
 
160 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  53.89 
 
 
177 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
171 aa  171  4e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  53.37 
 
 
166 aa  170  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  53.74 
 
 
160 aa  169  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  55.94 
 
 
160 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  56.03 
 
 
160 aa  167  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  51.27 
 
 
160 aa  167  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  55.24 
 
 
160 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  55.24 
 
 
160 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  52.38 
 
 
160 aa  167  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  54.55 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  55.24 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 
166 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  55.32 
 
 
160 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  51.68 
 
 
172 aa  165  3e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
161 aa  164  7e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
161 aa  164  7e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  51.02 
 
 
160 aa  162  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  52.69 
 
 
169 aa  163  1e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  51.01 
 
 
172 aa  162  2e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  53.19 
 
 
160 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  53.9 
 
 
160 aa  161  5e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  52.44 
 
 
167 aa  160  8e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
162 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  50.58 
 
 
166 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  51.83 
 
 
167 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  46.47 
 
 
195 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
163 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
169 aa  157  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  49.66 
 
 
170 aa  157  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  50.34 
 
 
174 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
167 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  48 
 
 
169 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  50.96 
 
 
179 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 
167 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 
219 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  53.02 
 
 
163 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
164 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  52.35 
 
 
178 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  53.05 
 
 
195 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
165 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
209 aa  152  3e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.67 
 
 
167 aa  152  3e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  51.81 
 
 
166 aa  150  6e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
166 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
159 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  52.44 
 
 
166 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  58.28 
 
 
164 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  51.53 
 
 
173 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 
166 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
160 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
159 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
160 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
160 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
161 aa  148  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  50 
 
 
166 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
166 aa  147  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
196 aa  147  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
196 aa  147  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  51.28 
 
 
171 aa  147  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
159 aa  146  1e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
159 aa  146  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
159 aa  146  1e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
166 aa  147  1e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
159 aa  146  1e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  46.95 
 
 
159 aa  146  1e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.39 
 
 
171 aa  145  2e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
159 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
165 aa  145  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 
166 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
163 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  51.22 
 
 
166 aa  144  4e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  46.45 
 
 
159 aa  144  4e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.11 
 
 
167 aa  144  4e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
162 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>