More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  61.21 
 
 
531 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5283  periplasmic dipeptide-binding protein, putative  73.16 
 
 
529 aa  770    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0087  bacterial extracellular solute-binding protein, family 5  73.06 
 
 
528 aa  776    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  63.02 
 
 
531 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4375  4-phytase  74.95 
 
 
525 aa  798    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.115651 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  62.57 
 
 
528 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5334  extracellular solute-binding protein  74.11 
 
 
535 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0223  extracellular solute-binding protein  73.23 
 
 
528 aa  759    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  62.57 
 
 
528 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0422  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.38 
 
 
528 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.537378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5538  extracellular solute-binding protein  72.3 
 
 
528 aa  765    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332617  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  62.18 
 
 
528 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  61.78 
 
 
531 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  59.03 
 
 
532 aa  667    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0349  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  61.78 
 
 
528 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.827651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  58.63 
 
 
528 aa  664    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
525 aa  1069    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.82 
 
 
528 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  61.98 
 
 
531 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5193  extracellular solute-binding protein  72.97 
 
 
529 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0587295  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  61.98 
 
 
534 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  62.57 
 
 
528 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0187  extracellular solute-binding protein  71.83 
 
 
529 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  61.78 
 
 
531 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70200  putative binding protein component of ABC dipeptide transporter  73.21 
 
 
526 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  61.98 
 
 
534 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.57 
 
 
528 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6093  putative dipeptide ABC transporter binding protein subunit  71.64 
 
 
526 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3091  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.57 
 
 
528 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  56.92 
 
 
531 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12520  dipeptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding component  56.72 
 
 
537 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0296833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  55.88 
 
 
531 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  55.53 
 
 
533 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5111  ABC transporter periplasmic binding protein  54 
 
 
532 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.914948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58360  putative binding protein component of ABC transpor  53.41 
 
 
532 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  49.7 
 
 
531 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0882  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  50.1 
 
 
544 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  48.91 
 
 
531 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 
531 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0921  extracellular solute-binding protein  49.5 
 
 
536 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.776476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4296  extracellular solute-binding protein  49.5 
 
 
531 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  49.31 
 
 
536 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  45.54 
 
 
535 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  43.61 
 
 
537 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  43.8 
 
 
537 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 
533 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  44.19 
 
 
535 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  44.36 
 
 
533 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 
531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  43.77 
 
 
533 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  45.17 
 
 
530 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  44.06 
 
 
535 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  43.1 
 
 
535 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  43.86 
 
 
532 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  44.58 
 
 
530 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  42.91 
 
 
535 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
531 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.72 
 
 
535 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.34 
 
 
530 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  42.15 
 
 
535 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
542 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
530 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  41.92 
 
 
532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  42.53 
 
 
535 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  42.72 
 
 
535 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  41.77 
 
 
540 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41.57 
 
 
535 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  41.57 
 
 
535 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  41.57 
 
 
535 aa  451  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  43.84 
 
 
529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 
541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 
547 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  41.83 
 
 
531 aa  445  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  41.83 
 
 
531 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  43.53 
 
 
531 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  41.73 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  42.64 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 
541 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  42.09 
 
 
542 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  41.79 
 
 
547 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
543 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  41 
 
 
526 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.55 
 
 
542 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  41.9 
 
 
542 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  41 
 
 
526 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  41.73 
 
 
542 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  40.33 
 
 
541 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
538 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.55 
 
 
542 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  41.55 
 
 
542 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>