More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  72.66 
 
 
437 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  72.24 
 
 
437 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  100 
 
 
438 aa  865    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  73.7 
 
 
439 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  73.93 
 
 
439 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  71.56 
 
 
436 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  69.58 
 
 
437 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  70.63 
 
 
430 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  70.87 
 
 
430 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  66.12 
 
 
431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  65.88 
 
 
431 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  65.64 
 
 
431 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  65.11 
 
 
431 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  69.42 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  69.42 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  65.65 
 
 
433 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  60.19 
 
 
435 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  60.19 
 
 
435 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  59.95 
 
 
435 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  59.95 
 
 
435 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 
435 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  59.24 
 
 
435 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  59.02 
 
 
434 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  58.78 
 
 
435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  58.53 
 
 
435 aa  512  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  56.91 
 
 
435 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  58.29 
 
 
435 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  57.82 
 
 
435 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  57.04 
 
 
435 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  55.27 
 
 
435 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  55.13 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  50.35 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 
430 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  51.41 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  47.65 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 
428 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 
428 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 
428 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 
428 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  45.52 
 
 
428 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 
428 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 
428 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 
428 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
428 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  51.17 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
440 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  49.16 
 
 
427 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  44.55 
 
 
428 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  45.02 
 
 
428 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  49.88 
 
 
430 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
427 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
427 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  49.65 
 
 
430 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  49.65 
 
 
430 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
427 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 
428 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  45.41 
 
 
427 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  49.65 
 
 
430 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 
427 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  44.94 
 
 
427 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
427 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
433 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 
427 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
427 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 
433 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 
441 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 
426 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  48.14 
 
 
433 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  45.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.92 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.15 
 
 
426 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  45.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 
428 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  48.36 
 
 
433 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 
433 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.92 
 
 
426 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 
433 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 
435 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 
429 aa  355  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 
429 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  45.64 
 
 
449 aa  354  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  45.52 
 
 
440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
437 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 
436 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 
429 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 
449 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  41.71 
 
 
427 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
427 aa  347  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
429 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 
423 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
433 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
429 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>