More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46450  Transporter, LysE family  100 
 
 
205 aa  393  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3513  lysine exporter protein LysE/YggA  62.25 
 
 
205 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0702628  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2250  lysine exporter protein LysE/YggA  66.83 
 
 
204 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.233575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2077  lysine exporter protein LysE/YggA  65.35 
 
 
204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3653  amino acid transporter LysE  64.85 
 
 
204 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2254  lysine exporter protein LysE/YggA  64.36 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.675856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0182  amino acid transporter LysE  58.82 
 
 
205 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3736  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  58.38 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7985  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.12 
 
 
209 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0428  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  49.5 
 
 
204 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3659  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 
233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3990  lysine exporter protein LysE/YggA  42.03 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0070  lysine exporter protein LysE/YggA  41.83 
 
 
207 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3769  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.89 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  33.33 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  33.33 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  33.33 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  33 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  32.83 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0116  lysine exporter protein LysE/YggA  29.11 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.57 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0992  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4218  L-lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  31.28 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  31.28 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  31.28 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  31.28 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.41 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  34.6 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.02 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  31.79 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  33 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.9 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4170  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319888  normal  0.802735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.62 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.66 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.56 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0043  lysine exporter protein LysE/YggA  36.67 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.173523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0976  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  32.43 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  37.14 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.85 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.31 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.61 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.79 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  32.34 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  33.96 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.33 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.36 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5806  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0827  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.59 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.282435 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6036  lysine exporter protein LysE/YggA  35.14 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957838  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.29 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  28.57 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0757  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.59 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  0.0580671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.29 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5446  lysine exporter protein LysE/YggA  36.69 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.71 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.5 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.54 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  33.74 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  32.37 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.66 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  33.76 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  35.76 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  29.67 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.62 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3551  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>