118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46360 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  510  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  55.47 
 
 
295 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  60.65 
 
 
286 aa  271  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  57.3 
 
 
303 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.5 
 
 
295 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
283 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  57.89 
 
 
297 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  54.61 
 
 
289 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  50 
 
 
285 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  56.93 
 
 
283 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  56.06 
 
 
283 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  58.52 
 
 
285 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  60.28 
 
 
307 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  67.9 
 
 
287 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  73.02 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  44.49 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  68.89 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  54.64 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  53.9 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  44.98 
 
 
297 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  42.47 
 
 
314 aa  204  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  46.15 
 
 
289 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  40.07 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  55.56 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  42.65 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  45.02 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  54.65 
 
 
290 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  43.38 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  46.18 
 
 
302 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.74 
 
 
296 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  37.95 
 
 
304 aa  185  9e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  44.29 
 
 
302 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  38.51 
 
 
311 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  44 
 
 
275 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  43.97 
 
 
297 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  46.18 
 
 
287 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  49.1 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  48.96 
 
 
194 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  38.77 
 
 
254 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  50.19 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.99 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  45.63 
 
 
319 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.69 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  32.39 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  29.49 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  31.16 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  30.16 
 
 
310 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.78 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  28.16 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.7 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  31.34 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  31.34 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.71 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  31.93 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  30.88 
 
 
308 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  30.84 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  30.69 
 
 
330 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
324 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  30.84 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  23.85 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  30.84 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.84 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.84 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  30.84 
 
 
310 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.84 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4737  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.92 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.72 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.54 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.05 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  30.17 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  29.61 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.5 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  29.95 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.9 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.71 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2400  hypothetical protein  30.84 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.59525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  29.36 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  28.65 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.67 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  28.7 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  25.6 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.4 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  33.58 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.26 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.28 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  32.84 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.05 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.34 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.13 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  29.02 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  27.7 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  31.68 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.56 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>