209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  100 
 
 
271 aa  533  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  42.8 
 
 
265 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  41.73 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  39.36 
 
 
271 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  29.79 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.93 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.21 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.43 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  29.21 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  30.07 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  30.41 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.95 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  31.21 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  28.83 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.91 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  28.57 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.14 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.24 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  31.14 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.72 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  27.05 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.3 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.09 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  27.44 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.78 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.52 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.99 
 
 
294 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.75 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.25 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.18 
 
 
301 aa  58.9  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  27.75 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  34.69 
 
 
151 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  29.87 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  27.32 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.41 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.05 
 
 
156 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.94 
 
 
297 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  25.09 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  25 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.64 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.61 
 
 
288 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  24.67 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  27.72 
 
 
307 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.16 
 
 
140 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  27.56 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.41 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  31.29 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
162 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.97 
 
 
145 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  32.17 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  26.89 
 
 
308 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.42 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.61 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  26.98 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  32.43 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  28.31 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  31.85 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  31.85 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  27.27 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.25 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  31.85 
 
 
145 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  29.31 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.42 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  25.08 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  26.02 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  31.69 
 
 
141 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  25.52 
 
 
147 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.51 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4916  UspA domain protein  32.12 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.74 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  27.14 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
147 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.93 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.03 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  26.37 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.08 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.14 
 
 
303 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.35 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  25.69 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  25 
 
 
143 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.03 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  26.24 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
166 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  27.65 
 
 
166 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  26.09 
 
 
304 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2280  universal stress protein UspA-like protein  26.12 
 
 
277 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00205289  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  24.64 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>