48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  75.29 
 
 		 268 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  75.29 
 
 		 268 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  76.54 
 
 		 265 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  73.76 
 
 		 268 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  73.38 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  72.62 
 
 		 268 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  73 
 
 		 268 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  72.62 
 
 		 268 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  69.37 
 
 		 268 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  68.63 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0081  lipopolysaccharide kinase  56.7 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382008  hitchhiker  0.000743328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4131  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  56.7 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00183874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  56.7 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.120387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4055  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  56.7 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03487  kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide  56.7 
 
 		 268 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3839  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  56.32 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000421355  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03439  hypothetical protein  56.7 
 
 		 265 aa  316  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3965  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  56.32 
 
 		 265 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  55.56 
 
 		 265 aa  310  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  55 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  55 
 
 		 265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  55 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  54.62 
 
 		 265 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  54.23 
 
 		 265 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  44.27 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  43.73 
 
 		 287 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  45.36 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.08 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  34.02 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  36.2 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  34.85 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5743  hypothetical protein  30.3 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.744614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66210  hypothetical protein  29.29 
 
 		 244 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2479  lipopolysaccharide kinase  29.27 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  0.508504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1364  lipopolysaccharide kinase  29.3 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0617  hypothetical protein  24.65 
 
 		 630 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0646208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0583  lipopolysaccharide kinase  29.19 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0886843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0469  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  33.86 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.365356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0370  lipopolysaccharide kinase  30 
 
 		 244 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>