95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  100 
 
 
326 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
331 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.38 
 
 
337 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  35.13 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.38 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.38 
 
 
337 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.06 
 
 
337 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.49 
 
 
337 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  34.6 
 
 
338 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  33.97 
 
 
338 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.97 
 
 
338 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  33.97 
 
 
338 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.65 
 
 
338 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.65 
 
 
338 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.33 
 
 
335 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  30.91 
 
 
336 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  31.17 
 
 
339 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  31.45 
 
 
336 aa  152  8e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  31.03 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  30.03 
 
 
338 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  31.35 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  31.1 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  31.1 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  31.1 
 
 
336 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  29.26 
 
 
326 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  27.19 
 
 
331 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.19 
 
 
331 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  28.73 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  28.22 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  27.27 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  28.22 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  28.22 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  27.91 
 
 
341 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  27.38 
 
 
341 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  27.91 
 
 
341 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  30.6 
 
 
283 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
316 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
278 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  30.22 
 
 
283 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
334 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  25.78 
 
 
305 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  27.64 
 
 
336 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
307 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
272 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  27.31 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  28.63 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  27.02 
 
 
347 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  26.46 
 
 
242 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  33.52 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  33.52 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  24.35 
 
 
347 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0702  glycosyl transferase family 8  24.91 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000654129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  28.47 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  25.82 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  23.83 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  25.17 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  24.82 
 
 
371 aa  77  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  25 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  29.11 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  25.33 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.45 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  26.1 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  30.41 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  24.12 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  26.8 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  25.64 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  24 
 
 
1014 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  24.64 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  26.22 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  22.78 
 
 
697 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
272 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  20.76 
 
 
316 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0711  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 
497 aa  52.8  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  26.11 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
401 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0994  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.32 
 
 
759 aa  50.8  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.624995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  29.31 
 
 
615 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  27.98 
 
 
610 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  20.14 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2389  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.352127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3270  glycosyl transferase family 8  24.9 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0060  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.12 
 
 
274 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00709812  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3139  glycosyl transferase family 8  29.59 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3410  glycosyl transferase family 8  27.72 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>