49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44620 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44620  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
391 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00918084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0487  FAD dependent oxidoreductase  76.23 
 
 
391 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0626947  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66000  hypothetical protein  77.78 
 
 
391 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00100924  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5726  hypothetical protein  77.52 
 
 
391 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0540  oxidoreductase, FAD-binding  73.66 
 
 
391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4980  FAD dependent oxidoreductase  74.68 
 
 
391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205637  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4931  FAD dependent oxidoreductase  74.94 
 
 
391 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119827  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0535  FAD dependent oxidoreductase  74.94 
 
 
391 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4803  FAD dependent oxidoreductase  74.68 
 
 
391 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.194271  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0614  FAD dependent oxidoreductase  78.01 
 
 
391 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.569661  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4980  oxidoreductase, FAD-binding protein  73.4 
 
 
391 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1960  FAD dependent oxidoreductase  38.62 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.75 
 
 
530 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
516 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.95 
 
 
526 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0369  FAD dependent oxidoreductase  39.39 
 
 
436 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 
559 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
543 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  25.08 
 
 
559 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
525 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
519 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.95 
 
 
525 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
559 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2442  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.8 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
582 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
559 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2572  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 
545 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.45 
 
 
361 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
566 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3499  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
522 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.426927 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
529 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
520 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0085  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.78 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 
562 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.8 
 
 
491 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
546 aa  43.9  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  24.57 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8013  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 
506 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.07 
 
 
557 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5519  FAD dependent oxidoreductase  45.1 
 
 
517 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0835202  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.82 
 
 
526 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.62 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
532 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
532 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.67 
 
 
582 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  31.82 
 
 
520 aa  42.7  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 
566 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>