181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  100 
 
 
537 aa  1058    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  53.51 
 
 
533 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  53.02 
 
 
534 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  51.6 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  52.85 
 
 
553 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  52.85 
 
 
551 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  52.05 
 
 
546 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  52.85 
 
 
551 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  52.85 
 
 
551 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  52.85 
 
 
551 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  52.85 
 
 
551 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  52.85 
 
 
551 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  52.18 
 
 
546 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  52.49 
 
 
551 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  51.97 
 
 
508 aa  539  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  51.01 
 
 
548 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  51.13 
 
 
539 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  51.33 
 
 
539 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  51.33 
 
 
539 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  51.34 
 
 
539 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  49.37 
 
 
555 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  49.62 
 
 
544 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  51.06 
 
 
539 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  51.06 
 
 
539 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  51.06 
 
 
539 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  48.28 
 
 
556 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  47.81 
 
 
558 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  49.71 
 
 
539 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  48.87 
 
 
552 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  48.3 
 
 
552 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  48.39 
 
 
531 aa  519  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  49.62 
 
 
539 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  50 
 
 
531 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  48.29 
 
 
531 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  48.89 
 
 
569 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  45.29 
 
 
547 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  44.69 
 
 
547 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  44.69 
 
 
547 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  44.08 
 
 
546 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  44.1 
 
 
551 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  43.51 
 
 
546 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  42.67 
 
 
559 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  42.29 
 
 
559 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  43.73 
 
 
546 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  42.83 
 
 
551 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  41.47 
 
 
538 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  41.81 
 
 
547 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6816  paraquat-inducible protein B'  43.21 
 
 
556 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  40 
 
 
543 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  41.56 
 
 
572 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2562  hypothetical protein  42.94 
 
 
558 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0758211  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  39.85 
 
 
552 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2391  hypothetical protein  44.75 
 
 
545 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931506  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  36.23 
 
 
559 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  33.78 
 
 
537 aa  312  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1323  Mammalian cell entry related domain protein  33.81 
 
 
561 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.404082  normal  0.550075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  32.59 
 
 
547 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  35.53 
 
 
546 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  35.73 
 
 
546 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  35.53 
 
 
546 aa  296  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  35.34 
 
 
546 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  36.13 
 
 
547 aa  292  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  34.42 
 
 
554 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  35.9 
 
 
547 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1746  paraquat-inducible protein B  35.59 
 
 
548 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  decreased coverage  0.000000731619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  34.03 
 
 
554 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0867784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  35.5 
 
 
550 aa  289  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  35.5 
 
 
550 aa  289  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  34.03 
 
 
554 aa  289  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  35.5 
 
 
550 aa  289  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2008  hypothetical protein  35.45 
 
 
547 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  32.77 
 
 
550 aa  286  9e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  33.39 
 
 
550 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  35.52 
 
 
545 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  36.19 
 
 
548 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  34.57 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  34.57 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  34.57 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  34.57 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  34.57 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  34.91 
 
 
548 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  32.77 
 
 
548 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  32.96 
 
 
548 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  34.78 
 
 
546 aa  263  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  34.52 
 
 
555 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  28.65 
 
 
554 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3077  putative paraquat-inducible protein B  28.65 
 
 
580 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.198785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02656  putative paraquat-inducible protein B  31 
 
 
555 aa  246  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2932  hypothetical protein  30.44 
 
 
548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  33.97 
 
 
694 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62020  paraquat-inducible protein B-like protein  40.13 
 
 
768 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0157201 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  33.07 
 
 
688 aa  234  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5396  hypothetical protein  40.06 
 
 
768 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1015  hypothetical protein  40.06 
 
 
767 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.428496  normal  0.236638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4563  hypothetical protein  38.89 
 
 
766 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.816323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>