221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 444 aa  900    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  75.62 
 
 		 452 aa  648    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  68.83 
 
 		 454 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  57.14 
 
 		 479 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  56.92 
 
 		 449 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  40.72 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  40.72 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  40.72 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  40.72 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  42.12 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  43.09 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  43.22 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  42.52 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  40 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  39.51 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  39.87 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  39.14 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  40.38 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  37.93 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  39.4 
 
 		 441 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.91 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37.38 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  39.29 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  39.2 
 
 		 448 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  38.73 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  39.91 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  36.22 
 
 		 446 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  39.33 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  37.33 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  37.3 
 
 		 468 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  36.44 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  38.46 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.95 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  36.88 
 
 		 426 aa  243  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  37.59 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  35.51 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  35.75 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  36.23 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  35.16 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  37.76 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  36.15 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.28 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  36.71 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  36.16 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  34.92 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  36.15 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  35.15 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  36 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  37.3 
 
 		 438 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  36.3 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  35.93 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.53 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  35.18 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.3 
 
 		 421 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  35.06 
 
 		 429 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  33.26 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  35.13 
 
 		 429 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.82 
 
 		 429 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  34.55 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.12 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  34.89 
 
 		 433 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  35.08 
 
 		 417 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  34.43 
 
 		 435 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  35.19 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  35.57 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  34.7 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.76 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.82 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  35.41 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.55 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  35.86 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  34.36 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  35.48 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  36.47 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  35.65 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  33.77 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  35.94 
 
 		 421 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  35.2 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  35.63 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  34.55 
 
 		 423 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  35.8 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  33.95 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.4 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  34.98 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  33.03 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  34.92 
 
 		 412 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36.18 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.1 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  37 
 
 		 409 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  33.78 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  33.78 
 
 		 415 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  34.91 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  34.92 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.71 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  34.92 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  33.56 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  35.28 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  35.1 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  33.18 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  34.86 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>