More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.65 
 
 
971 aa  841  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43120  periplasmic sensory histidine protein kinase  100 
 
 
830 aa  1674  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03280  hybrid sensory histidine protein kinase  43.79 
 
 
957 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.558043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
679 aa  241  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  35.92 
 
 
685 aa  235  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  36.14 
 
 
1317 aa  220  9e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.18 
 
 
657 aa  212  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3217  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
699 aa  211  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
699 aa  210  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
530 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
437 aa  202  2e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
618 aa  199  2e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.16 
 
 
1233 aa  198  4e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.79 
 
 
935 aa  194  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3226  bacterioferritin  30.58 
 
 
696 aa  193  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
602 aa  193  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.64 
 
 
1236 aa  193  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1267 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.18 
 
 
502 aa  191  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
1611 aa  191  6e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1236 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
763 aa  189  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
783 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1238 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
1578 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1230 aa  188  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1238 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1238 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
1236 aa  188  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
1236 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
1236 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1238 aa  187  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1041 aa  186  1e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
803 aa  186  1e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
1118 aa  186  2e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.8 
 
 
404 aa  185  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1131 aa  184  5e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1245 aa  184  5e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
901 aa  184  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 
1188 aa  184  8e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
708 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1234 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  31.38 
 
 
1200 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
1202 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1234 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  39.59 
 
 
938 aa  180  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1193 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1193 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1007 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1582 aa  176  1e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  2.34203e-05 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
570 aa  176  1e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
697 aa  176  1e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
878 aa  176  1e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1046  histidine kinase  42.19 
 
 
489 aa  176  2e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00874969  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1314 aa  175  2e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  37.54 
 
 
1077 aa  175  3e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
1041 aa  174  4e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  41.04 
 
 
779 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  40.16 
 
 
746 aa  174  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
633 aa  173  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
869 aa  173  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0965  Cache sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
743 aa  173  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
856 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1358  histidine kinase  40.4 
 
 
288 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.688927  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.89 
 
 
948 aa  171  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
778 aa  167  6e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
661 aa  167  6e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
929 aa  167  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
865 aa  167  1e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3685  histidine kinase  41.1 
 
 
510 aa  166  2e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3120  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
752 aa  166  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
965 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
784 aa  165  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2973  diguanylate cyclase  25.7 
 
 
679 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.439966  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
637 aa  163  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
765 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
893 aa  161  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
484 aa  161  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1767 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1767 aa  161  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
973 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1070 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
620 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.71 
 
 
1763 aa  159  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.03 
 
 
1046 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 
833 aa  159  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 
1626 aa  158  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
918 aa  158  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
770 aa  157  5e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
1771 aa  158  5e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
673 aa  157  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
816 aa  157  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2378  PAS  29.73 
 
 
901 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.756345  normal  0.766649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  33.65 
 
 
1280 aa  156  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1659 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  37.45 
 
 
786 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
763 aa  155  3e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
786 aa  155  3e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
507 aa  155  3e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1023 aa  155  3e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>