More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 
255 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  75.29 
 
 
255 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  77.25 
 
 
255 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  72.55 
 
 
255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  74.12 
 
 
255 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  69.41 
 
 
255 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  68.63 
 
 
255 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  68.24 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  70.98 
 
 
255 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  50.97 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  44.02 
 
 
269 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
253 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  45.67 
 
 
254 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  45.34 
 
 
259 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  46.59 
 
 
260 aa  198  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  42.19 
 
 
262 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  49.62 
 
 
277 aa  198  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  46.64 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 
288 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  37.35 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  46.88 
 
 
270 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  44.44 
 
 
290 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  41.57 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  44.05 
 
 
288 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  42.75 
 
 
414 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.19 
 
 
266 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  41.44 
 
 
282 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  43.65 
 
 
288 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
259 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  46.28 
 
 
266 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  46.28 
 
 
266 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  46.28 
 
 
266 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  40.64 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
268 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
490 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
272 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  46.64 
 
 
255 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
274 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.64 
 
 
424 aa  186  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
272 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  42.06 
 
 
272 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  44.36 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
293 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  42 
 
 
259 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  42.58 
 
 
418 aa  182  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  45.56 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  40.78 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
536 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.9 
 
 
405 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
264 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  40.93 
 
 
419 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.47 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  36.82 
 
 
418 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  44.98 
 
 
260 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  41.09 
 
 
267 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  43.46 
 
 
272 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  42.31 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  43.03 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  44.49 
 
 
261 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.46 
 
 
265 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.19 
 
 
271 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
292 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  43.53 
 
 
268 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  45.75 
 
 
285 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 
270 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  45.31 
 
 
271 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
278 aa  175  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  44.75 
 
 
280 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  41.09 
 
 
255 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
255 aa  175  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  41.09 
 
 
255 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  41.09 
 
 
255 aa  175  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.52 
 
 
269 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  46.78 
 
 
271 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  45.75 
 
 
258 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  41.86 
 
 
267 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  45.87 
 
 
270 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
264 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  44.84 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  44.58 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  42.86 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  37.11 
 
 
455 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.41 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  44.62 
 
 
274 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  40.32 
 
 
254 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  41.63 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  40.82 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  36.68 
 
 
265 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  35.55 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  41.5 
 
 
259 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  41.09 
 
 
262 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>