28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42550 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  352  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  67.37 
 
 		 226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  62.63 
 
 		 259 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  58.88 
 
 		 262 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  59.69 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  57.28 
 
 		 266 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  56.52 
 
 		 266 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  80.67 
 
 		 258 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  78.99 
 
 		 267 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  58.95 
 
 		 247 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  71.32 
 
 		 256 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  41.41 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  46.46 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  47.83 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  45.88 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  45.12 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  37.04 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  31.98 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  31.33 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  34.09 
 
 		 615 aa  51.2  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1621  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215267  unclonable  0.000000000374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 1190 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  36.36 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  41.56 
 
 		 1193 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 968 aa  43.9  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>