41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  48.94 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  44.29 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  43.79 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  45.58 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  41.94 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  40.32 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  29.33 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  29.45 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  29.73 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  29.01 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  31.06 
 
 		 158 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  30.37 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  43.21 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0898  hypothetical protein  43.24 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  27.41 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  25.83 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  29.37 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  28 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  28.67 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  28.8 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  26.92 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  29.03 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  38.46 
 
 		 217 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  30.47 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1799  hypothetical protein  38.46 
 
 		 253 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627108  normal  0.339394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  30.47 
 
 		 149 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  40.68 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  28.03 
 
 		 188 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  46.51 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>