More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  98.01 
 
 		 403 aa  824    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  97.52 
 
 		 403 aa  821    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  92.25 
 
 		 406 aa  779    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  100 
 
 		 403 aa  840    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  72.25 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  60.39 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  61.13 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  61.38 
 
 		 411 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  60.73 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  60.99 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  61.26 
 
 		 402 aa  505  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  61.26 
 
 		 387 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  60.47 
 
 		 402 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  60.21 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  60.47 
 
 		 402 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  61.89 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  60.21 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  59.51 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  60.73 
 
 		 402 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  60.21 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  60.21 
 
 		 402 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  59.69 
 
 		 402 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  59.95 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  61.14 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  60.5 
 
 		 382 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  60.5 
 
 		 382 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  58.42 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  58.05 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  58.05 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.76 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  51.91 
 
 		 422 aa  388  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  48.46 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  44.57 
 
 		 422 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  45.57 
 
 		 408 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  44.58 
 
 		 408 aa  325  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  43.12 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  43.12 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  60.54 
 
 		 231 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  40.39 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  60 
 
 		 219 aa  288  9e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.29 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  36.55 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  36.55 
 
 		 397 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  33.07 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  36.75 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  36.75 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  36.19 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1254  IS605 family transposase OrfB  34.03 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  37.11 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  35.98 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.31 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  34.8 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  33.98 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  33.33 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0757  IS605 family transposase OrfB  33.07 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.825829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  35.25 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  36.08 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  32.55 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  36.57 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  32.91 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  33.95 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.75 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  35.61 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  32.4 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  34.24 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 		 377 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  32.71 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  32.23 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  34.45 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  32.22 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  36.11 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.69 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.84 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  35.35 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  31.96 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  33.16 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  32.23 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  32.23 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  32.23 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  31.96 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  32.22 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.36 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.25 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  32.63 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  32.63 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  31.47 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  31.25 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  34.49 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  31.74 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.3 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32 
 
 		 363 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  33.92 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  34.31 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  31.88 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.73 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>