More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  100 
 
 
276 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  77.01 
 
 
294 aa  411  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  74.45 
 
 
276 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  70.7 
 
 
276 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  71.17 
 
 
276 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4747  modification methylase HemK  74.45 
 
 
276 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0844052  normal  0.0658003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  71.01 
 
 
276 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  68.13 
 
 
277 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  70.8 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  69.93 
 
 
276 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  67.03 
 
 
277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  58.33 
 
 
281 aa  289  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  56.82 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  56.7 
 
 
283 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.72 
 
 
276 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  56.27 
 
 
279 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  52.29 
 
 
282 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  54.55 
 
 
276 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  52.75 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.47 
 
 
277 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  52.47 
 
 
277 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  50.18 
 
 
284 aa  265  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  53.65 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.47 
 
 
277 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  49.46 
 
 
298 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  52.31 
 
 
284 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.47 
 
 
277 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  56.59 
 
 
286 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  51.71 
 
 
277 aa  262  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.71 
 
 
277 aa  262  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.71 
 
 
277 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.71 
 
 
277 aa  262  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  52.61 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  52.33 
 
 
284 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.23 
 
 
277 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.71 
 
 
277 aa  261  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  51.62 
 
 
285 aa  261  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.23 
 
 
277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.23 
 
 
277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.23 
 
 
277 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.88 
 
 
276 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  51.15 
 
 
285 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  54.3 
 
 
285 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.5 
 
 
276 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  53.23 
 
 
277 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  53.36 
 
 
285 aa  255  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  51.54 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  51.15 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  51.15 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  51.15 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  48.3 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  50.77 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  47.83 
 
 
288 aa  251  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  51.15 
 
 
282 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  50.38 
 
 
286 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  48.21 
 
 
288 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  50.38 
 
 
286 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  56.03 
 
 
285 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  50.78 
 
 
286 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  50.74 
 
 
284 aa  248  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  55.29 
 
 
281 aa  248  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  50.78 
 
 
280 aa  247  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  48.84 
 
 
280 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  55.11 
 
 
295 aa  246  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  50 
 
 
280 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  50.38 
 
 
279 aa  244  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3684  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.45 
 
 
280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0936698  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  47.51 
 
 
279 aa  242  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  47.19 
 
 
281 aa  241  1e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  46.21 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  45.85 
 
 
287 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  45.56 
 
 
277 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.22 
 
 
275 aa  224  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  45.17 
 
 
277 aa  222  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  52.47 
 
 
280 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  50.39 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  52.83 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  50.98 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  55.86 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  50.98 
 
 
283 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  48.05 
 
 
275 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  43.28 
 
 
301 aa  216  4e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  51.38 
 
 
286 aa  215  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  51.31 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  50 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.38 
 
 
286 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  53.49 
 
 
283 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.39 
 
 
280 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  48.25 
 
 
284 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  51.31 
 
 
287 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  50.58 
 
 
280 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.38 
 
 
283 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.31 
 
 
283 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  49.81 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  49.81 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  49.81 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  49.81 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1772  HemK family modification methylase  40.42 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  49.81 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  49.81 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>