219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 454 aa  929    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  68.83 
 
 		 444 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  70.11 
 
 		 452 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  60.36 
 
 		 449 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  61 
 
 		 479 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  43.78 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  42.26 
 
 		 446 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  42.6 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  43.43 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  42.25 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  42.25 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  42.25 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  42.25 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  42.25 
 
 		 441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  42 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  41.56 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  40.89 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  41.78 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  41.7 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  41.05 
 
 		 448 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  37.42 
 
 		 443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  38.8 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  38.38 
 
 		 441 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.7 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  38.48 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  38.02 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  38.02 
 
 		 444 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  37.27 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  36.75 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  36.75 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  36.53 
 
 		 444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  36.91 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  36.18 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  36.12 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.56 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.56 
 
 		 420 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  36.4 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  35.54 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  36.05 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  36.05 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  35.78 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  37.84 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  34.19 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.82 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  35.58 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  35.81 
 
 		 429 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  35.63 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  37.13 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  36.93 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  35.56 
 
 		 421 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  35.33 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  35.97 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  35.7 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  36.28 
 
 		 468 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  35.7 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  35.87 
 
 		 421 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  35.65 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  37.41 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  33.48 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  36.49 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  36.04 
 
 		 416 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  37.17 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  35.81 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  34.71 
 
 		 467 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  33.1 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.44 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  32.22 
 
 		 433 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.57 
 
 		 413 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.76 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  34.96 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  35.44 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  34.75 
 
 		 428 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  35.21 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  33.92 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  33.41 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.62 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  34.91 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  34.62 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  34.65 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  34.3 
 
 		 417 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  35.87 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  34.76 
 
 		 418 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  35.2 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.03 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  34 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  34.29 
 
 		 412 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  34.76 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  33.63 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  31.78 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.91 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  34.52 
 
 		 418 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.11 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  33.19 
 
 		 422 aa  220  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  33.63 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  31.29 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  34.76 
 
 		 409 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  33.71 
 
 		 416 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.23 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  31.62 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  33.93 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>