More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39890 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
708 aa  1447    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
710 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  36.09 
 
 
811 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 
811 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  34.33 
 
 
728 aa  354  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 
718 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 
716 aa  279  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 
774 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 
729 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 
710 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 
710 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
712 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
726 aa  238  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 
742 aa  234  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 
728 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
727 aa  231  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 
730 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 
727 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 
727 aa  228  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.45 
 
 
724 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 
751 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 
743 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
706 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 
698 aa  223  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 
743 aa  223  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 
750 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
743 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 
743 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 
724 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  28.77 
 
 
730 aa  211  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
725 aa  211  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 
772 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 
743 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  27.95 
 
 
705 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 
719 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
762 aa  208  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 
809 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 
777 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 
708 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 
749 aa  202  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
702 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
805 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 
757 aa  201  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
819 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 
734 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
738 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
702 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 
742 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 
729 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.4 
 
 
744 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  28.4 
 
 
708 aa  195  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 
772 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 
685 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 
772 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.37 
 
 
804 aa  194  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 
726 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
728 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
753 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 
722 aa  191  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.49 
 
 
727 aa  191  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
707 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
707 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 
729 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  27.14 
 
 
707 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 
731 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.07 
 
 
804 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  27.79 
 
 
703 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
753 aa  188  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
737 aa  188  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.35 
 
 
746 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 
715 aa  186  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 
730 aa  185  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 
728 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  27.57 
 
 
771 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
768 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.12 
 
 
704 aa  183  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.45 
 
 
778 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 
755 aa  181  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 
754 aa  180  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 
804 aa  180  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  25.9 
 
 
737 aa  180  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
714 aa  179  2e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 
802 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 
710 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 
721 aa  177  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
823 aa  177  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 
729 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 
808 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
828 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 
879 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
770 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 
797 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 
710 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
708 aa  170  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 
733 aa  168  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 
696 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
828 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
709 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>