133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  100 
 
 		 615 aa  1219    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  41.84 
 
 		 632 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0807  hypothetical protein  39.97 
 
 		 616 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  39.75 
 
 		 619 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  38.8 
 
 		 612 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  38.36 
 
 		 593 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  38.58 
 
 		 615 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  32.64 
 
 		 616 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  33.6 
 
 		 613 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  37.36 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  36.53 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  35.86 
 
 		 607 aa  349  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  36.85 
 
 		 619 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  37.9 
 
 		 625 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2302  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.26 
 
 		 607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4277  DNA helicase II  34.91 
 
 		 314 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.260274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  25.96 
 
 		 593 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  23.02 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  24.33 
 
 		 617 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.09 
 
 		 737 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0239  NERD domain-containing protein  26.4 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  27.06 
 
 		 663 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  30.04 
 
 		 734 aa  73.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  27.92 
 
 		 711 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  20.14 
 
 		 827 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  27.76 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  20.7 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1771  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 508 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 697 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  24.53 
 
 		 617 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  29.23 
 
 		 712 aa  64.7  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  21.79 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  20.94 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 		 695 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  24.54 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  24.54 
 
 		 689 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  24.54 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0729  hypothetical protein  25.19 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 695 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  23.31 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 691 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  22.13 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  23.81 
 
 		 759 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  25.84 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 691 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  24.18 
 
 		 691 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  25.64 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1058  hypothetical protein  22.97 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0139648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1706  NERD domain protein  27.65 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.516506  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2424  NERD domain protein  23.47 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0422  hypothetical protein  26.36 
 
 		 554 aa  57  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0827  hypothetical protein  24.88 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0844  hypothetical protein  24.88 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0342  NERD domain protein  24.6 
 
 		 550 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0285  NERD domain protein  35.06 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 809 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  25.07 
 
 		 631 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 716 aa  54.7  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0847  hypothetical protein  24.36 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  26.42 
 
 		 699 aa  53.9  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  25.2 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  30.33 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  24.48 
 
 		 778 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1146  hypothetical protein  25.28 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.72 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.1 
 
 		 696 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  27.82 
 
 		 687 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0445  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  29.59 
 
 		 666 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  24.38 
 
 		 269 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3351  NERD domain-containing protein  27.72 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164276  hitchhiker  0.000169391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  21.93 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3988  hypothetical protein  42.59 
 
 		 57 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00319492  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  30 
 
 		 705 aa  48.5  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  22.77 
 
 		 394 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  23 
 
 		 703 aa  48.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 671 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0515  hypothetical protein  29.45 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0189041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 848 aa  47.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0845  hypothetical protein  24.93 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0545753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  21.47 
 
 		 724 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.18 
 
 		 798 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.59 
 
 		 858 aa  45.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.71 
 
 		 788 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1359  hypothetical protein  27.54 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5176  hypothetical protein  24.61 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.798305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 603 aa  45.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  23.69 
 
 		 723 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  20.9 
 
 		 724 aa  45.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>