More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  100 
 
 
289 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1484  elongation factor Ts  89.62 
 
 
289 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17070  elongation factor Ts  89.62 
 
 
289 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  84.78 
 
 
287 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  80.28 
 
 
287 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  78.2 
 
 
287 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  77.51 
 
 
287 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  79.24 
 
 
287 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  79.24 
 
 
287 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  78.89 
 
 
287 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  78.89 
 
 
287 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  310  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  57.79 
 
 
283 aa  309  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  57.79 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  57.79 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  57.79 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  58.82 
 
 
283 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  57.79 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  58.48 
 
 
285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  58.48 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  57.44 
 
 
283 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  57.09 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  57.44 
 
 
285 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  57.44 
 
 
285 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  57.44 
 
 
285 aa  300  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  56.7 
 
 
292 aa  300  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  57.34 
 
 
286 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  56.75 
 
 
285 aa  298  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.05 
 
 
289 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  54.45 
 
 
292 aa  289  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  54.11 
 
 
292 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  58.48 
 
 
290 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  55.82 
 
 
290 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  53.98 
 
 
293 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  55.56 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  57.91 
 
 
306 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  51.85 
 
 
293 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  53.79 
 
 
294 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  51.74 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  54.45 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  51.03 
 
 
292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  51.03 
 
 
292 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  51.03 
 
 
292 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  53.76 
 
 
292 aa  266  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  48.11 
 
 
291 aa  265  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  50.34 
 
 
296 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  50.34 
 
 
296 aa  265  8e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  52.63 
 
 
282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  48 
 
 
302 aa  252  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  54.55 
 
 
283 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03236  elongation factor Ts  55.32 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  47.35 
 
 
292 aa  243  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  49.15 
 
 
292 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  49.48 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  48.46 
 
 
292 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  48.44 
 
 
294 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  54.04 
 
 
282 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  54.12 
 
 
280 aa  235  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427669  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  48.44 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  44.59 
 
 
294 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  45.02 
 
 
291 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  47.83 
 
 
294 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2634  elongation factor Ts  54.7 
 
 
282 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000554469  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  45.77 
 
 
291 aa  224  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002747  translation elongation factor Ts  54.39 
 
 
281 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000973884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3280  elongation factor Ts  52.36 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141167  hitchhiker  0.0000739911 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  40.36 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2884  elongation factor Ts  52.73 
 
 
303 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000033426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.47 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  43.39 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  44.17 
 
 
290 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  46.49 
 
 
293 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  46.49 
 
 
293 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  44.3 
 
 
291 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  45.26 
 
 
294 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1630  elongation factor Ts  51.75 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  46.58 
 
 
291 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  44.01 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  47.64 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1349  elongation factor Ts  51.4 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2640  elongation factor Ts  51.4 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024092  normal  0.161673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2707  elongation factor Ts  51.4 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000189418  normal  0.0108139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2814  elongation factor Ts  51.4 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000281155  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.48 
 
 
294 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  44.76 
 
 
313 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  44.37 
 
 
296 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0685  elongation factor Ts  42.91 
 
 
291 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000446628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  46.49 
 
 
291 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1555  elongation factor Ts  50.91 
 
 
283 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000849908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1271  elongation factor Ts  50.91 
 
 
283 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000259112  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4882  translation elongation factor Ts  42.72 
 
 
314 aa  209  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42 
 
 
303 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>