More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  59.63 
 
 
853 aa  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  59.63 
 
 
853 aa  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
870 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
858 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 
871 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  84.71 
 
 
857 aa  1478    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  54.6 
 
 
939 aa  869    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1359  DNA mismatch repair protein MutS  51.97 
 
 
870 aa  786    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219365  normal  0.0149931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  87.25 
 
 
855 aa  1536    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  63.16 
 
 
854 aa  1041    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  58.76 
 
 
861 aa  998    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1151  DNA mismatch repair protein MutS  54.58 
 
 
882 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.75556  normal  0.534383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1186  DNA mismatch repair protein MutS  54.6 
 
 
884 aa  846    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  57.14 
 
 
872 aa  971    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  60.14 
 
 
871 aa  1025    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2842  DNA mismatch repair protein MutS  53.07 
 
 
870 aa  785    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147304  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  58.41 
 
 
856 aa  974    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  83.98 
 
 
855 aa  1481    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 
858 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  59.39 
 
 
862 aa  1002    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  57.61 
 
 
856 aa  975    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  54.71 
 
 
891 aa  871    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  52.71 
 
 
846 aa  842    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  52.82 
 
 
846 aa  841    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  83.98 
 
 
859 aa  1481    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 
1058 aa  639    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  55.21 
 
 
860 aa  865    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 
932 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1111  DNA mismatch repair protein MutS  55.2 
 
 
922 aa  856    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.88674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  54.94 
 
 
891 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 
900 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  55.18 
 
 
850 aa  839    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  54.71 
 
 
939 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
881 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  55.24 
 
 
938 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  60.86 
 
 
863 aa  1002    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  84.11 
 
 
860 aa  1477    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4552  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 
871 aa  743    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
870 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5394  DNA mismatch repair protein MutS  54.59 
 
 
885 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.74748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  63.41 
 
 
874 aa  1098    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  57.41 
 
 
856 aa  980    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.84 
 
 
872 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  59.09 
 
 
851 aa  994    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  55.58 
 
 
871 aa  948    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 
872 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  46.99 
 
 
868 aa  749    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  58.04 
 
 
853 aa  991    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  54.21 
 
 
902 aa  896    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  57.59 
 
 
856 aa  981    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 
928 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  54.72 
 
 
893 aa  878    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  58.33 
 
 
859 aa  996    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  57.89 
 
 
855 aa  982    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  57.59 
 
 
856 aa  981    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  57.83 
 
 
856 aa  983    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 
872 aa  640    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  57.08 
 
 
883 aa  1013    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1832  DNA mismatch repair protein MutS  49.37 
 
 
882 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  60.28 
 
 
887 aa  1038    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  58.97 
 
 
851 aa  996    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  55.7 
 
 
884 aa  911    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  55.7 
 
 
884 aa  911    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  51.09 
 
 
864 aa  793    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1617  DNA mismatch repair protein MutS  54.55 
 
 
878 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  56.96 
 
 
862 aa  965    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.34 
 
 
887 aa  647    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  59.6 
 
 
853 aa  989    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  65.03 
 
 
859 aa  1085    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2274  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 
911 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.103313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 
1040 aa  653    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1075  DNA mismatch repair protein MutS  55.43 
 
 
916 aa  860    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.835373  normal  0.410772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0209  DNA mismatch repair protein MutS  56.02 
 
 
855 aa  948    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 
882 aa  640    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  59.63 
 
 
853 aa  983    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2052  DNA mismatch repair protein MutS  49.15 
 
 
890 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.292542  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5989  DNA mismatch repair protein MutS  54.59 
 
 
885 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  57.16 
 
 
854 aa  959    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  56.64 
 
 
889 aa  969    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  84.71 
 
 
857 aa  1479    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  59.91 
 
 
859 aa  1019    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  58.97 
 
 
851 aa  993    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  84.25 
 
 
880 aa  1472    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  56.16 
 
 
856 aa  976    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 
860 aa  985    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  58.64 
 
 
861 aa  996    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  58.64 
 
 
861 aa  997    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  62.19 
 
 
878 aa  1013    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  56.34 
 
 
861 aa  971    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.67 
 
 
859 aa  715    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  59.14 
 
 
868 aa  918    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  54.64 
 
 
886 aa  863    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  87.25 
 
 
855 aa  1535    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 
870 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  56.69 
 
 
859 aa  970    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  54.71 
 
 
939 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  54.71 
 
 
939 aa  870    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2088  DNA mismatch repair protein MutS  54.7 
 
 
885 aa  847    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
857 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.05 
 
 
889 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>