More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  100 
 
 		 401 aa  768    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  63.8 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  62.89 
 
 		 402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  58.7 
 
 		 407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  62.05 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  64.47 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  54.35 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  54.35 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  59.51 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  63.87 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  59.27 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 405 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 395 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 405 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  51.59 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  52.37 
 
 		 398 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  50.97 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  50 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  48.07 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  48.07 
 
 		 400 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  47.81 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  39.9 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  52.09 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  40.05 
 
 		 406 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  40.05 
 
 		 406 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  40.05 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  51.05 
 
 		 399 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  51.21 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  52.94 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.89 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 399 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  45.53 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 394 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 406 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.64 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.5 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.5 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  44.63 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  41.64 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  41.64 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.06 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  38.83 
 
 		 411 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 431 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  39.94 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  40.5 
 
 		 394 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  40.22 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  40.22 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  40.22 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  40.22 
 
 		 394 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.434106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>