More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  100 
 
 
353 aa  702    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  79.49 
 
 
354 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  78.63 
 
 
354 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  78.69 
 
 
354 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  77.84 
 
 
352 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  78.35 
 
 
354 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  79.89 
 
 
349 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  79.02 
 
 
349 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  74.79 
 
 
354 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  74.43 
 
 
353 aa  541  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  73.94 
 
 
353 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  61.78 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  58.24 
 
 
405 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  58.74 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  59.31 
 
 
357 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  59.6 
 
 
362 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  57.59 
 
 
379 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  58.81 
 
 
408 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  58.81 
 
 
383 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  58.74 
 
 
429 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  58.81 
 
 
361 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  58.24 
 
 
407 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  54.13 
 
 
358 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  59.54 
 
 
369 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  57.43 
 
 
392 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
400 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
404 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
400 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
406 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  58.29 
 
 
400 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  58 
 
 
403 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  56.32 
 
 
348 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  53.73 
 
 
355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  53.13 
 
 
355 aa  354  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  51.03 
 
 
352 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2332  DNA-directed DNA polymerase  53.8 
 
 
353 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.353166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  50.59 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  50.59 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  50.29 
 
 
359 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  49.7 
 
 
357 aa  325  6e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  49.11 
 
 
358 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  47.94 
 
 
358 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  44.13 
 
 
350 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  48.22 
 
 
359 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  47.92 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  48.82 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  48.82 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  49.28 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  48.82 
 
 
358 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  48.6 
 
 
359 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  49.56 
 
 
357 aa  318  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  48.81 
 
 
358 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  49.56 
 
 
352 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  48 
 
 
360 aa  315  8e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  49.56 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  47.93 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  50.44 
 
 
352 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00753  DNA polymerase IV  48.5 
 
 
349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  47.32 
 
 
360 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.663031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  48.99 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  48.99 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0894  DNA polymerase IV  49.56 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  48.68 
 
 
351 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0460  DNA polymerase IV  47.92 
 
 
356 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
351 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  48.7 
 
 
351 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  46.31 
 
 
353 aa  305  7e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  48.84 
 
 
354 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  51.76 
 
 
355 aa  305  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  46.57 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  48.69 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  46.29 
 
 
372 aa  299  4e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  48.13 
 
 
352 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  48.13 
 
 
352 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  47.84 
 
 
352 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0957  DNA polymerase IV  49.83 
 
 
304 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  51.48 
 
 
353 aa  293  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  46.33 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1342  DNA polymerase IV  44.7 
 
 
359 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  47.16 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  43.39 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  43.8 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1040  DNA polymerase IV  45.56 
 
 
352 aa  282  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  48.99 
 
 
378 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  48.99 
 
 
378 aa  279  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  48.16 
 
 
359 aa  278  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 
359 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  46.13 
 
 
359 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  46.35 
 
 
378 aa  276  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.76 
 
 
374 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.24 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>