More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  80.75 
 
 
399 aa  659  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  79.5 
 
 
400 aa  681  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  80.25 
 
 
415 aa  655  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  78.32 
 
 
399 aa  655  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  80.5 
 
 
399 aa  659  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  80.25 
 
 
415 aa  655  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  80.51 
 
 
412 aa  644  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  77.16 
 
 
401 aa  645  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  100 
 
 
400 aa  826  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  91.82 
 
 
399 aa  753  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  86.67 
 
 
399 aa  717  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  74.49 
 
 
400 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  74.49 
 
 
400 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  64.36 
 
 
467 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  63.01 
 
 
444 aa  515  1e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  65.34 
 
 
401 aa  516  1e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  65.09 
 
 
401 aa  514  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.88668e-10  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  64.5 
 
 
400 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  40.41 
 
 
411 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  66.3 
 
 
181 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  40 
 
 
397 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  40.98 
 
 
384 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  39.85 
 
 
384 aa  232  7e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  35.03 
 
 
393 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  82.11 
 
 
143 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  31.98 
 
 
388 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.54 
 
 
434 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  29.48 
 
 
429 aa  135  1e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  29.12 
 
 
451 aa  135  1e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  28.3 
 
 
452 aa  134  2e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  28.2 
 
 
451 aa  129  1e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.54 
 
 
463 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.89 
 
 
400 aa  122  1e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  27.34 
 
 
452 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.74 
 
 
432 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.74 
 
 
379 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.74 
 
 
387 aa  115  1e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.14 
 
 
402 aa  114  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  26.2 
 
 
451 aa  111  2e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.24 
 
 
376 aa  109  7e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.24 
 
 
376 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.49 
 
 
376 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  23.99 
 
 
376 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.97 
 
 
422 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.27 
 
 
430 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.48 
 
 
412 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  25.06 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.54 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  25.89 
 
 
420 aa  93.6  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  24.57 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  23.99 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.94 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.95 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.24 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.38 
 
 
439 aa  89.4  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  26.03 
 
 
401 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.33 
 
 
417 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  24.75 
 
 
451 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.91 
 
 
433 aa  85.5  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.02 
 
 
410 aa  84.7  2e-15  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  30 
 
 
449 aa  84.7  3e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.69 
 
 
482 aa  83.6  5e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  27 
 
 
410 aa  83.6  6e-15  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.23 
 
 
424 aa  83.2  7e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 
456 aa  83.2  7e-15  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.67 
 
 
367 aa  82.8  9e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.96 
 
 
403 aa  82.8  1e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  24.43 
 
 
451 aa  82.4  1e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.48 
 
 
389 aa  82.8  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  26.85 
 
 
404 aa  81.6  2e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.85 
 
 
415 aa  81.6  2e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.56 
 
 
448 aa  82  2e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  24.18 
 
 
451 aa  81.3  3e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.74 
 
 
413 aa  80.9  3e-14  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.9 
 
 
394 aa  80.1  6e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  24.76 
 
 
413 aa  79.7  7e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.72 
 
 
402 aa  79.7  9e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  20.51 
 
 
388 aa  79.7  9e-14  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  25.25 
 
 
417 aa  78.2  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  26.78 
 
 
411 aa  78.2  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  41.12 
 
 
137 aa  78.6  2e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  28.74 
 
 
417 aa  77.4  5e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  29.85 
 
 
414 aa  77  6e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.31 
 
 
337 aa  77  6e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  24.41 
 
 
444 aa  75.9  1e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.34 
 
 
402 aa  75.5  1e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  75.5  2e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  31.44 
 
 
328 aa  75.1  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  27.37 
 
 
381 aa  74.7  3e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  30.04 
 
 
413 aa  74.3  3e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  22.11 
 
 
443 aa  73.6  6e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  25.21 
 
 
439 aa  72.8  9e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  32.06 
 
 
356 aa  72.4  1e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.81 
 
 
432 aa  72  2e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.43 
 
 
425 aa  71.2  3e-11  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  26.16 
 
 
404 aa  71.2  3e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  25.96 
 
 
380 aa  71.2  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  22.68 
 
 
421 aa  71.2  3e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.56 
 
 
414 aa  71.2  3e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.07 
 
 
401 aa  70.5  5e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>