More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35300 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  76.24 
 
 
209 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  72.82 
 
 
207 aa  321  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  73.17 
 
 
208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  74.15 
 
 
208 aa  316  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  71.22 
 
 
207 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  70.39 
 
 
213 aa  305  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  72 
 
 
208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  67.98 
 
 
211 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  68.29 
 
 
208 aa  290  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  66.83 
 
 
208 aa  278  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  61.31 
 
 
210 aa  260  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  57.21 
 
 
208 aa  231  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.48 
 
 
1287 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  31.75 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  30.92 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  31.13 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
364 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  29.03 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  32.56 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  33.72 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  29.49 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  29.49 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  28.87 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  28.76 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  27.18 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
201 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
214 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  61.6  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  28.68 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  27.42 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  27.89 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.75 
 
 
196 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
277 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
348 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  25.91 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.46 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  34.9 
 
 
440 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  26.8 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5435  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0879885  hitchhiker  0.0072084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 
305 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  31.58 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
353 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  25.7 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  24.35 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1564  conserved hypothetical protein, possible methyltransferase  24.65 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  26.87 
 
 
377 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0361  Methyltransferase type 12  28 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  30.92 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.04 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  29.03 
 
 
200 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
218 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  29.71 
 
 
220 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
253 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
224 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1044  thiopurine S-methyltransferase  34.34 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.72 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.43 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  26.28 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  29.58 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  29.66 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
346 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 
312 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  28.43 
 
 
251 aa  50.1  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>