56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  100 
 
 
863 aa  1663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  41.94 
 
 
847 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  42.28 
 
 
854 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  40.63 
 
 
860 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1917  hypothetical protein  36.55 
 
 
510 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1629  hypothetical protein  30.32 
 
 
633 aa  92.8  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  26.86 
 
 
1100 aa  91.7  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  27.34 
 
 
1108 aa  88.2  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  27.36 
 
 
1066 aa  88.2  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  27.36 
 
 
1068 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  27.36 
 
 
1070 aa  87.8  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  26.49 
 
 
1154 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  26.49 
 
 
1148 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  26.1 
 
 
1164 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  26.49 
 
 
1120 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1205  hypothetical protein  27.33 
 
 
702 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1472  hypothetical protein  25.93 
 
 
712 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  32.76 
 
 
1086 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  31.79 
 
 
1104 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  28.72 
 
 
1307 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1084  hypothetical protein  24.06 
 
 
888 aa  77  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  31.68 
 
 
1205 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0618  hypothetical protein  29.71 
 
 
673 aa  76.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4714  hypothetical protein  26.24 
 
 
882 aa  75.1  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  32.47 
 
 
1134 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  25.52 
 
 
863 aa  71.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  29.31 
 
 
1058 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1553  hypothetical protein  23.63 
 
 
891 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0122844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0209  hypothetical protein  25.35 
 
 
1131 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2169  hypothetical protein  29.14 
 
 
700 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375483  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  28.25 
 
 
1222 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1372  hypothetical protein  25.15 
 
 
707 aa  64.7  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.709287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1045  hypothetical protein  22.78 
 
 
857 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0251387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1120  hypothetical protein  26.67 
 
 
688 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000538221  normal  0.614169 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  25.1 
 
 
863 aa  58.9  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  24.67 
 
 
870 aa  57.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  22.88 
 
 
867 aa  57.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2003  hypothetical protein  26.85 
 
 
879 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  24.69 
 
 
863 aa  55.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1619  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01353  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1312  hypothetical protein  24.56 
 
 
1076 aa  54.3  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01366  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1468  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2274  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1770  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.930224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2264  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0095574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1566  hypothetical protein  25.85 
 
 
879 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  23.29 
 
 
879 aa  49.7  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1693  hypothetical protein  22.98 
 
 
878 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190171 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1510  hypothetical protein  22.98 
 
 
878 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1766  hypothetical protein  22.98 
 
 
878 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.916643  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1826  hypothetical protein  22.98 
 
 
878 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1763  hypothetical protein  22.98 
 
 
878 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0322713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4479  hypothetical protein  27.27 
 
 
1057 aa  48.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4966  hypothetical protein  25.98 
 
 
1093 aa  45.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>