More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.73 
 
 		 914 aa  1058    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  100 
 
 		 914 aa  1846    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  56.09 
 
 		 918 aa  938    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  56.52 
 
 		 918 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  39.58 
 
 		 765 aa  361  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1363 aa  326  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 		 1763 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 1014 aa  323  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1765 aa  318  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 		 1266 aa  317  9e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 682 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 920 aa  314  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1767 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 		 1767 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.88 
 
 		 1765 aa  313  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1260 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 812 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1202 aa  311  4e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.58 
 
 		 1346 aa  311  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1768 aa  310  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 818 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1771 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 		 921 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 		 816 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1398 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1767 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1040 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 1313 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1390 aa  301  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 818 aa  301  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 738 aa  301  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 993 aa  301  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.92 
 
 		 925 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 1042 aa  299  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.24 
 
 		 1135 aa  299  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.36 
 
 		 852 aa  299  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.57 
 
 		 1442 aa  299  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1397 aa  299  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.15 
 
 		 1499 aa  297  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 		 636 aa  297  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  35.27 
 
 		 1683 aa  297  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.18 
 
 		 1053 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 1165 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 957 aa  295  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  37.45 
 
 		 925 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  34.96 
 
 		 931 aa  294  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.4 
 
 		 796 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  31.22 
 
 		 940 aa  294  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 758 aa  294  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 929 aa  294  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1326 aa  293  7e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1582 aa  293  8e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1255 aa  293  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  37.45 
 
 		 942 aa  293  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1310 aa  293  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1316 aa  292  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 928 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1959 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 916 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.3 
 
 		 1322 aa  292  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  37.88 
 
 		 785 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.15 
 
 		 923 aa  291  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.23 
 
 		 932 aa  291  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 985 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 946 aa  291  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 977 aa  290  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 948 aa  290  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 1340 aa  290  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  38.34 
 
 		 785 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 981 aa  290  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.17 
 
 		 937 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  35.92 
 
 		 727 aa  290  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.09 
 
 		 1331 aa  289  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.44 
 
 		 929 aa  289  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  35.96 
 
 		 783 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.96 
 
 		 1692 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.92 
 
 		 932 aa  288  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  34.37 
 
 		 818 aa  288  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1611 aa  287  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1251 aa  288  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.06 
 
 		 847 aa  287  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.38 
 
 		 1177 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 770 aa  287  7e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1166 aa  287  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  37.03 
 
 		 1214 aa  286  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  37.41 
 
 		 977 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  38.22 
 
 		 1407 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 922 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 964 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  38.4 
 
 		 785 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  36.52 
 
 		 1021 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  36.55 
 
 		 778 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.47 
 
 		 2213 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 967 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  28.71 
 
 		 979 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.85 
 
 		 917 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  40.12 
 
 		 786 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  37.24 
 
 		 917 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.99 
 
 		 1109 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>