89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34850 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
199 aa  396  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  68.84 
 
 
210 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  66.67 
 
 
211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  65.33 
 
 
200 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  64.32 
 
 
210 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  62.81 
 
 
210 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  62.81 
 
 
212 aa  224  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  62.81 
 
 
210 aa  222  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  64.82 
 
 
210 aa  221  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  61.81 
 
 
210 aa  218  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  63.82 
 
 
199 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  39.29 
 
 
207 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  46.7 
 
 
221 aa  148  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  45.7 
 
 
207 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  42.41 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  45.03 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  42.93 
 
 
221 aa  128  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  34.17 
 
 
223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  41.29 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  38.61 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  38.35 
 
 
210 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  31.25 
 
 
200 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  31.25 
 
 
242 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  31.25 
 
 
238 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  35 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  34.54 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  27.32 
 
 
206 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.31 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  37.44 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  37.78 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  26.73 
 
 
242 aa  79  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  26.49 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.42 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  29.41 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  33.5 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  36.36 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  29.73 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  25.73 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  26.47 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  32.82 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  25.76 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  36.02 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  26.44 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  31.79 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.14 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  29.84 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  24.77 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  28.5 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  26.16 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.89 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.89 
 
 
206 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.89 
 
 
206 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.55 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  26.42 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.78 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  29.63 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  21.62 
 
 
328 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  29.7 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  25.99 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.08 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  28.08 
 
 
217 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.28 
 
 
336 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.06 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1239  DsbA-like thioredoxin domain-containing protein  32.5 
 
 
219 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  26.52 
 
 
233 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2566  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  40 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.901141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  26.78 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
225 aa  45.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  26.23 
 
 
230 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  20.43 
 
 
319 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  26.23 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  28.18 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  28.09 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  28.09 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  28.09 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  26.52 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  29.71 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  36.36 
 
 
227 aa  41.6  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  25.56 
 
 
214 aa  41.6  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4106  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 
229 aa  41.2  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>