108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  100 
 
 
185 aa  387  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  53.11 
 
 
321 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  77.39 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
316 aa  164  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  42.8 
 
 
277 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 
319 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  39.83 
 
 
319 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  39.83 
 
 
319 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  39.83 
 
 
319 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  37.61 
 
 
320 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  40.81 
 
 
259 aa  141  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  35.56 
 
 
314 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  52.63 
 
 
321 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  54.26 
 
 
216 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  51.96 
 
 
170 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
327 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
316 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  33.64 
 
 
284 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
330 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
330 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
355 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
348 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
330 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
330 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  58.75 
 
 
330 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  56.79 
 
 
153 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  31.02 
 
 
314 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  56.25 
 
 
463 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  59.15 
 
 
329 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  59.15 
 
 
329 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  59.15 
 
 
329 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  59.15 
 
 
286 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  53.09 
 
 
320 aa  95.5  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  43.4 
 
 
128 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  64.71 
 
 
265 aa  81.3  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  54.76 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  50 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  50.57 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  50 
 
 
303 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  49.41 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  29.22 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  29.22 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  50.85 
 
 
83 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  28.23 
 
 
329 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  44.58 
 
 
221 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  28.81 
 
 
323 aa  64.3  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
323 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
238 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 
463 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  36.59 
 
 
497 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  36.59 
 
 
325 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  36.59 
 
 
333 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  36.59 
 
 
325 aa  57.8  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  36.59 
 
 
327 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  36.59 
 
 
329 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  36.59 
 
 
441 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
321 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  38.1 
 
 
321 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  38.1 
 
 
333 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  39.29 
 
 
323 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  35.37 
 
 
325 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  35.37 
 
 
325 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  30.17 
 
 
323 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  41.03 
 
 
229 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  48.08 
 
 
53 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  25.66 
 
 
332 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  26.32 
 
 
343 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  40 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  34.52 
 
 
323 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  40.43 
 
 
83 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  31.25 
 
 
607 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5016  hypothetical protein  56.76 
 
 
114 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0556  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0761  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1356  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1848  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2128  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2140  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.746404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2171  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2279  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2391  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3083  ISGsu7, transposase OrfB  37.7 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  40 
 
 
374 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  40 
 
 
374 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
374 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
374 aa  42.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  30.38 
 
 
349 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>