More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  57.71 
 
 
203 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  55.12 
 
 
214 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  53.99 
 
 
214 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  57.81 
 
 
205 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  54.63 
 
 
212 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  54.11 
 
 
214 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  54.59 
 
 
242 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  56.63 
 
 
226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  56.83 
 
 
193 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  50.49 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  44.51 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  56.69 
 
 
177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  56.35 
 
 
177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  56.35 
 
 
177 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  56.92 
 
 
177 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  57.94 
 
 
197 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  44.32 
 
 
173 aa  158  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  53.49 
 
 
181 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  54.4 
 
 
181 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  55.2 
 
 
178 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  53.17 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  40.72 
 
 
179 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  41.83 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  41.83 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  52.03 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  47.66 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  45.11 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  45.59 
 
 
208 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  45.59 
 
 
208 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  46.09 
 
 
133 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  47.2 
 
 
205 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
207 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  48.39 
 
 
221 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  48.28 
 
 
283 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  45.69 
 
 
275 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  48.28 
 
 
283 aa  120  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  48.28 
 
 
283 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  45.83 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  45.69 
 
 
271 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  40.62 
 
 
209 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  40.62 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
273 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
273 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
273 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
273 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  45.3 
 
 
273 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  35.83 
 
 
258 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  43.9 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2387  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.05451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  34.2 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  40.3 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1717  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
324 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00794283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.15 
 
 
226 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  36.36 
 
 
173 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  41.38 
 
 
283 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.8 
 
 
150 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  39.74 
 
 
225 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  39.55 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  45.16 
 
 
287 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  45.16 
 
 
279 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  42.06 
 
 
160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  41.54 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1684  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  40.15 
 
 
212 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  42.4 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
255 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  38.64 
 
 
249 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  36.51 
 
 
167 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  47.37 
 
 
221 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  40.6 
 
 
226 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
391 aa  106  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  42.74 
 
 
177 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.85 
 
 
183 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  39.42 
 
 
192 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  42.28 
 
 
224 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.23 
 
 
169 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  40.28 
 
 
225 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  41.46 
 
 
234 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
223 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
223 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  42.15 
 
 
192 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
234 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  40.62 
 
 
170 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
223 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  41.48 
 
 
190 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>