More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  100 
 
 
1023 aa  2065    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  65.04 
 
 
616 aa  769    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  65.53 
 
 
616 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  45.19 
 
 
619 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  44.94 
 
 
613 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  41.06 
 
 
614 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  41.23 
 
 
619 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  41.57 
 
 
628 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  41.6 
 
 
602 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 
627 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 
602 aa  356  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1750  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  81.77 
 
 
203 aa  347  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47790  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  78.82 
 
 
203 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198648  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4118  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  77.34 
 
 
203 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 
624 aa  332  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 
617 aa  330  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  36.89 
 
 
630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 
627 aa  327  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 
628 aa  324  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 
613 aa  317  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  35.46 
 
 
641 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 
627 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  37.23 
 
 
593 aa  312  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1641  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  72.91 
 
 
203 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0176417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  35.82 
 
 
623 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 
612 aa  304  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 
624 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 
626 aa  301  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 
627 aa  301  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  32.37 
 
 
623 aa  301  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 
626 aa  300  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 
638 aa  298  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1708  cob(I)alamin adenosyltransferase  72.91 
 
 
203 aa  297  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1271  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  72.41 
 
 
203 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457484  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  34.62 
 
 
680 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1231  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  71.43 
 
 
203 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.865471  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1672  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  71.92 
 
 
203 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4047  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  71.92 
 
 
203 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 
624 aa  295  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  34.56 
 
 
617 aa  294  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  34.35 
 
 
821 aa  294  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 
597 aa  293  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3681  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  71.92 
 
 
203 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.269652  hitchhiker  0.0049814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2664  cob(I)alamin adenosyltransferase  70.41 
 
 
206 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509276  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.51 
 
 
685 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.51 
 
 
685 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.51 
 
 
685 aa  292  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
698 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 
629 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  34.51 
 
 
685 aa  291  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2206  cob(I)alamin adenosyltransferase  67.96 
 
 
206 aa  291  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.911739  normal  0.20755 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.34 
 
 
685 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  34.34 
 
 
685 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  33.61 
 
 
615 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  34.54 
 
 
631 aa  284  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2786  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  64.59 
 
 
209 aa  283  9e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 
628 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 
617 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0657  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  69.07 
 
 
213 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.79 
 
 
614 aa  280  8e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  34.61 
 
 
621 aa  280  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3752  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  69.46 
 
 
202 aa  275  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 
632 aa  275  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2291  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  69.39 
 
 
200 aa  271  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  32.91 
 
 
697 aa  271  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  32.91 
 
 
620 aa  268  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 
637 aa  264  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.18 
 
 
631 aa  259  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.51 
 
 
631 aa  259  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  32.34 
 
 
622 aa  258  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2213  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 
621 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604823  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02140  cob(I)alamin adenosyltransferase  65.67 
 
 
203 aa  256  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.896738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2814  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  64.45 
 
 
209 aa  255  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719244  normal  0.830692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.75 
 
 
614 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.6 
 
 
614 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0278  cob(I)alamin adenosyltransferase  62.56 
 
 
203 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.75 
 
 
614 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.75 
 
 
614 aa  252  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.75 
 
 
614 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  31.12 
 
 
645 aa  251  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.85 
 
 
616 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.9 
 
 
615 aa  245  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 
735 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1380  cob(I)alamin adenosyltransferase  59.79 
 
 
204 aa  242  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.27 
 
 
614 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.82 
 
 
631 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0120  cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase  63.18 
 
 
204 aa  241  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.11 
 
 
614 aa  241  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.11 
 
 
614 aa  241  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0795  cob(I)alamin adenosyltransferase  62.44 
 
 
204 aa  241  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.25714  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 
621 aa  240  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.95 
 
 
614 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 
638 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 
611 aa  239  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.95 
 
 
614 aa  239  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.01 
 
 
614 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 
642 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 
642 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 
642 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2737  cob(I)alamin adenosyltransferase  57 
 
 
201 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0317015  normal  0.149736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>