91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 339 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  77.78 
 
 		 339 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  76.88 
 
 		 339 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  79.17 
 
 		 337 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  74.26 
 
 		 340 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  75.15 
 
 		 341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  72.44 
 
 		 317 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  69.32 
 
 		 362 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  58.01 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  53.22 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  54.46 
 
 		 340 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  54.49 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  53.56 
 
 		 332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  52.84 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  52.58 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  52.24 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  52.24 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  52.84 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  52.4 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.3 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  52.9 
 
 		 347 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.78 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.12 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.1 
 
 		 343 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  52.4 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  52.4 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  52.4 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  52.4 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  50.61 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  48.39 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  50.48 
 
 		 351 aa  315  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  50 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  44.44 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.5 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.57 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.18 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  41.59 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.54 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.54 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  40.07 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  38.48 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.54 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.54 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  37.1 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  40.91 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.14 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  40.58 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  36.48 
 
 		 346 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  33.65 
 
 		 338 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  35.31 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  33.02 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.85 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.88 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.88 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.12 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.79 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  32.38 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5012  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.9 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0114898  normal  0.178041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0774  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.09 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0489455 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1350  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.995375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.83 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1383  putative alkanesulfonates binding protein precursor  29.91 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3714  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.15 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0106391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3405  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0556  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.409832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0286  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0103216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1272  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1012  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.153923  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1303  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2013  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.12 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2528  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.82 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.47 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4671  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.58 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3697  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.58 
 
 		 326 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5629  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.52 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265966  normal  0.757434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4880  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.87 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.779449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1469  aliphatic compound ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.13 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3439  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.95 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4021  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.51 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.391639  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.48 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4201  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.71 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4089  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.71 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4333  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.1 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>