More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  53.12 
 
 
225 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  51.33 
 
 
225 aa  225  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.45 
 
 
237 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6494  ABC transporter related  52.59 
 
 
236 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.87798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5638  ABC transporter related  52.59 
 
 
236 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6003  ABC transporter related  52.59 
 
 
236 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  47.77 
 
 
227 aa  221  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 
228 aa  221  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.45 
 
 
227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6149  ABC transporter related  51.06 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.463374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  50.91 
 
 
237 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  50.91 
 
 
237 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  50.45 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.09 
 
 
234 aa  217  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.09 
 
 
234 aa  217  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
236 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.78 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7412  ABC efflux pump, ATPase subunit  50.86 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.05 
 
 
236 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  50 
 
 
227 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
227 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  52.73 
 
 
244 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
238 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.72 
 
 
233 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  48.88 
 
 
230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.64 
 
 
234 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.44 
 
 
715 aa  214  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  45.45 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  48.91 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.32 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.08 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  51.82 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.82 
 
 
227 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  48.86 
 
 
234 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  48.86 
 
 
256 aa  211  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4456  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
239 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  49.78 
 
 
240 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.19 
 
 
226 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 
228 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  48.06 
 
 
238 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 
224 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.23 
 
 
232 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  49.33 
 
 
241 aa  208  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.86 
 
 
249 aa  208  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  45.61 
 
 
239 aa  209  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.38 
 
 
239 aa  208  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  48.68 
 
 
244 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
224 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.21 
 
 
238 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  50.23 
 
 
221 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  49.09 
 
 
253 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.56 
 
 
253 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
237 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  49.77 
 
 
258 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  49.54 
 
 
238 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  47.3 
 
 
234 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  47.3 
 
 
234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  50.89 
 
 
250 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.88 
 
 
246 aa  206  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 
227 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.84 
 
 
233 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.52 
 
 
234 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  48.4 
 
 
228 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  46.69 
 
 
291 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  45.42 
 
 
248 aa  206  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  46.05 
 
 
242 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  46.51 
 
 
227 aa  205  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.11 
 
 
253 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.22 
 
 
240 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  46.19 
 
 
233 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.77 
 
 
224 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  46.82 
 
 
240 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
248 aa  205  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
222 aa  205  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  48.2 
 
 
237 aa  205  7e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  204  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  44.69 
 
 
228 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 
224 aa  204  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  47.11 
 
 
244 aa  204  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  43.75 
 
 
229 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.86 
 
 
230 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.49 
 
 
231 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  44.14 
 
 
224 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  45.7 
 
 
241 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.09 
 
 
260 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>