172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28210 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  100 
 
 
207 aa  417  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  72.46 
 
 
207 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  72.46 
 
 
207 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  74.04 
 
 
208 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  74.04 
 
 
208 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  70.67 
 
 
208 aa  309  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  67.15 
 
 
206 aa  290  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  63.77 
 
 
207 aa  277  7e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  63.29 
 
 
207 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  63.29 
 
 
228 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  62.56 
 
 
211 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  46.15 
 
 
210 aa  187  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  43.19 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.21 
 
 
233 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  43.68 
 
 
233 aa  158  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.18 
 
 
238 aa  148  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.3 
 
 
208 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.75 
 
 
214 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.89 
 
 
202 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  38.92 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  38.38 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.46 
 
 
208 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.74 
 
 
211 aa  131  6e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  34.74 
 
 
211 aa  131  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.5 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.13 
 
 
207 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.91 
 
 
219 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.15 
 
 
205 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.16 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.41 
 
 
230 aa  117  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  35.41 
 
 
230 aa  117  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.58 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.56 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.39 
 
 
212 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.41 
 
 
223 aa  114  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.39 
 
 
210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1694  periplasmic chaperone LolA  33.18 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.972431  normal  0.23288 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.56 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.97 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.66 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.15 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00895  outer-membrane lipoprotein carrier protein precursor  35 
 
 
204 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00902  hypothetical protein  35 
 
 
204 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2752  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2437  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0718725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0996  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00638939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2229  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583755  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1053  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0514291  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.015889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2705  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0180788  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.63 
 
 
215 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.16 
 
 
205 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  38.24 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.15 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.73 
 
 
211 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1415  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.47 
 
 
204 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.560758  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.68 
 
 
215 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.61 
 
 
244 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.36 
 
 
244 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.65 
 
 
216 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.65 
 
 
216 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1842  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33 
 
 
198 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.66 
 
 
210 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1075  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1026  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0995  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1060  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
203 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0187172  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.8 
 
 
231 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.15 
 
 
213 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2758  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32 
 
 
244 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.94 
 
 
216 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003878  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.37 
 
 
208 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000605758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2482  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.04 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000211708  hitchhiker  0.000000303985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01798  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.37 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0626  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.9 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0165352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3255  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.4 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00308863  hitchhiker  0.000000000848281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1562  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36 
 
 
236 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32 
 
 
203 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.146126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.8 
 
 
203 aa  98.6  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0706  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.68 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2121  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3076  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.132409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.05 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0791  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.654977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2623  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2989  outer-membrane lipoprotein carrier protein  36.84 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3041  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1989  outer-membrane lipoprotein carrier protein  35.33 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0848  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255068  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0795  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.2 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.06 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0497  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0836  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0976  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0937  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.723645  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4079  outer-membrane lipoprotein carrier protein  34.67 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.79 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3177  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
213 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.05 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>