122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  763    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  72.16 
 
 
400 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  66.85 
 
 
409 aa  494  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  67.02 
 
 
438 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  62.43 
 
 
408 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  64.42 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  56.37 
 
 
407 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  56.49 
 
 
412 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  54.69 
 
 
408 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  55.38 
 
 
407 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  57.64 
 
 
406 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  49.6 
 
 
413 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  53.51 
 
 
415 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  55.91 
 
 
409 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  49.33 
 
 
413 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  52.83 
 
 
411 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  54.45 
 
 
411 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  56.06 
 
 
409 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  52.16 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  55.91 
 
 
409 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  53.58 
 
 
410 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  54.1 
 
 
420 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50 
 
 
420 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  48.91 
 
 
433 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  48.66 
 
 
402 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  48.63 
 
 
433 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  46.51 
 
 
411 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  50.13 
 
 
413 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  46.63 
 
 
416 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  48.77 
 
 
413 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  45.26 
 
 
411 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  47.04 
 
 
407 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  46.77 
 
 
407 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  47.17 
 
 
407 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  46.51 
 
 
407 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.32 
 
 
415 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  42.39 
 
 
409 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  43.99 
 
 
444 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  43.73 
 
 
410 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  42.86 
 
 
410 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  43.96 
 
 
410 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  41.6 
 
 
427 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.88 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  36.59 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.47 
 
 
419 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  35.41 
 
 
405 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.16 
 
 
408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  33.96 
 
 
406 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.05 
 
 
421 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  31.08 
 
 
418 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.35 
 
 
400 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.08 
 
 
400 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  28.11 
 
 
409 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.34 
 
 
409 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.02 
 
 
413 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.7 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  27.32 
 
 
416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  25.87 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.87 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  32.28 
 
 
400 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  31.88 
 
 
359 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
396 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  29.07 
 
 
406 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.51 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.18 
 
 
402 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  32.1 
 
 
178 aa  93.2  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.5 
 
 
391 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.49 
 
 
376 aa  89.7  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.65 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.09 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  32.22 
 
 
817 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.07 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  24.06 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.67 
 
 
277 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  22.19 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.11 
 
 
397 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.44 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  26.03 
 
 
305 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  26.04 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  22.48 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.44 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.51 
 
 
425 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  24.72 
 
 
282 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
1177 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 
1177 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.03 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  19.17 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.75 
 
 
251 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.95 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  18.87 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.45 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  24.92 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  23.44 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
513 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  23.62 
 
 
411 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
245 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  23.4 
 
 
300 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>