More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27710 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  100 
 
 
1221 aa  2542    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  45.18 
 
 
1415 aa  811    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  39.18 
 
 
921 aa  358  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.35 
 
 
699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 
733 aa  321  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
732 aa  317  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
828 aa  312  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 
828 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
828 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 
589 aa  310  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.3 
 
 
589 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
789 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
754 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.68 
 
 
585 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
789 aa  302  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 
754 aa  302  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.76 
 
 
1106 aa  296  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
734 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.81 
 
 
790 aa  296  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
598 aa  295  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
626 aa  295  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
824 aa  294  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 
790 aa  293  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 
633 aa  292  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  32.21 
 
 
776 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  32.21 
 
 
776 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  32.21 
 
 
776 aa  291  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  32.21 
 
 
821 aa  290  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
619 aa  290  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 
821 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 
776 aa  290  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.73 
 
 
529 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
776 aa  287  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
968 aa  286  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
1714 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.28 
 
 
1106 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 
833 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  38.68 
 
 
833 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 
667 aa  279  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
595 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.51 
 
 
596 aa  271  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.29 
 
 
708 aa  268  4e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  35.39 
 
 
781 aa  265  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.98 
 
 
937 aa  265  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 
1143 aa  263  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.13 
 
 
797 aa  258  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.85 
 
 
715 aa  258  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 
717 aa  257  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
717 aa  253  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
627 aa  253  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
693 aa  247  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
779 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.85 
 
 
739 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
822 aa  246  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  36.24 
 
 
1116 aa  245  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
713 aa  245  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  29.7 
 
 
780 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
780 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
796 aa  238  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
727 aa  238  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  29.21 
 
 
1144 aa  233  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.73 
 
 
723 aa  229  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.98 
 
 
739 aa  228  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
3035 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
718 aa  227  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
3560 aa  227  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
974 aa  224  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.86 
 
 
739 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.79 
 
 
742 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
633 aa  216  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
647 aa  214  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.06 
 
 
740 aa  212  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
1094 aa  205  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
750 aa  200  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
909 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
700 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 
552 aa  190  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
4489 aa  189  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
750 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.3 
 
 
793 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
1085 aa  186  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
647 aa  183  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
616 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
732 aa  181  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
808 aa  180  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.2 
 
 
630 aa  180  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.46 
 
 
680 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
706 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.87 
 
 
816 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  34.25 
 
 
632 aa  175  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
654 aa  175  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.86 
 
 
553 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 
611 aa  171  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
740 aa  171  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
724 aa  164  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
574 aa  162  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
667 aa  162  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 
761 aa  162  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
660 aa  161  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>