More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  100 
 
 
369 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  73.76 
 
 
367 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  71.47 
 
 
368 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  70.17 
 
 
372 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  72.25 
 
 
370 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  70.05 
 
 
370 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  69.23 
 
 
370 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  60.38 
 
 
378 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  61 
 
 
380 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  61.56 
 
 
376 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  60.77 
 
 
375 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  57.57 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  57.3 
 
 
369 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  57.3 
 
 
369 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
370 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  56.76 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  57.03 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  57.03 
 
 
368 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.49 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  56.22 
 
 
369 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  56.63 
 
 
369 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  56.49 
 
 
369 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  56.35 
 
 
369 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  58.5 
 
 
395 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  55.49 
 
 
371 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  56.94 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.52 
 
 
369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  55.31 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  56.39 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  57.02 
 
 
332 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  55.43 
 
 
359 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  56.18 
 
 
382 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.15 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  56.35 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  57.22 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  55 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  54.22 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  58.06 
 
 
365 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.75 
 
 
359 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  53.24 
 
 
371 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  53.37 
 
 
368 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 
372 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.37 
 
 
368 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  54.08 
 
 
367 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  54.78 
 
 
361 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  55.9 
 
 
332 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  54.97 
 
 
360 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  54.59 
 
 
383 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  54.3 
 
 
382 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  54.55 
 
 
371 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.78 
 
 
391 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  54.87 
 
 
336 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  55.9 
 
 
332 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  54.97 
 
 
368 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.89 
 
 
373 aa  391  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  55.92 
 
 
338 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  54.3 
 
 
382 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  55.34 
 
 
333 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  53.37 
 
 
366 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  54.67 
 
 
385 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  54.87 
 
 
364 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  54.67 
 
 
385 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  54.67 
 
 
385 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  57.02 
 
 
333 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  55.71 
 
 
332 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  53.64 
 
 
384 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  55.71 
 
 
332 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  52.35 
 
 
364 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  55.18 
 
 
334 aa  381  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  53.93 
 
 
361 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  52.1 
 
 
353 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  53.31 
 
 
360 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.5 
 
 
369 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  56.51 
 
 
334 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  55.71 
 
 
332 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.5 
 
 
369 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  54.6 
 
 
336 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.5 
 
 
369 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  55.43 
 
 
332 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  54.32 
 
 
357 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  53.91 
 
 
369 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  53.91 
 
 
361 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  55.06 
 
 
332 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  54.85 
 
 
333 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  54.62 
 
 
334 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  53.33 
 
 
361 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  53.33 
 
 
361 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.19 
 
 
381 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  53.63 
 
 
380 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  52.34 
 
 
372 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.89 
 
 
362 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  53.37 
 
 
364 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  55.15 
 
 
385 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  52.81 
 
 
360 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>