More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  858    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  62.24 
 
 
438 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  58.84 
 
 
437 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  60.97 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  61.78 
 
 
460 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  56.59 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  57.14 
 
 
443 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  56.6 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  53.54 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  52.05 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  50.89 
 
 
460 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  49.31 
 
 
453 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  47.23 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  49.87 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  37.66 
 
 
430 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  38.48 
 
 
447 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  42.3 
 
 
426 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  41.45 
 
 
433 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  42.3 
 
 
421 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  38.61 
 
 
443 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  42.08 
 
 
433 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  42.08 
 
 
433 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  40.63 
 
 
431 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  41.82 
 
 
433 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  39.8 
 
 
436 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  39.05 
 
 
415 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  36.41 
 
 
432 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  42.56 
 
 
434 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  40 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 
429 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  37.4 
 
 
434 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 
456 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  44.36 
 
 
438 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  39.37 
 
 
434 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  39.37 
 
 
434 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  39.08 
 
 
434 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  39.08 
 
 
434 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  35.18 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  34.04 
 
 
469 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  35.18 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  37.24 
 
 
414 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  46.96 
 
 
293 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.53 
 
 
494 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  32.92 
 
 
511 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  44.64 
 
 
289 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  44.64 
 
 
289 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  40.87 
 
 
291 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  43.27 
 
 
291 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  34 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  31.99 
 
 
493 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  40.47 
 
 
290 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  36.82 
 
 
261 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  38.36 
 
 
275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  31.25 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  36.65 
 
 
273 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  36.77 
 
 
257 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.87 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.25 
 
 
404 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  35.52 
 
 
453 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  36.32 
 
 
257 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  44.81 
 
 
258 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  34.61 
 
 
404 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.63 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  31.64 
 
 
594 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  35.09 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  29.1 
 
 
536 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.14 
 
 
258 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  28.76 
 
 
536 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  36.4 
 
 
271 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  32.74 
 
 
405 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  37.76 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  35.27 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  37.76 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  33.97 
 
 
278 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  28.76 
 
 
535 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  33.03 
 
 
258 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  31.5 
 
 
552 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  31.13 
 
 
571 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  31.5 
 
 
552 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  31.25 
 
 
560 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  30.88 
 
 
571 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  31.25 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  31.25 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  36.13 
 
 
253 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  36.13 
 
 
253 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  36.79 
 
 
253 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  31.91 
 
 
289 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  32.33 
 
 
289 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  38.51 
 
 
255 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>