34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26700 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  45.5 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  44.59 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  41.63 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  51.97 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  51.97 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  52.99 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  52.59 
 
 		 179 aa  138  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  52.99 
 
 		 328 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  52.99 
 
 		 288 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  52.59 
 
 		 174 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  52.99 
 
 		 301 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  33.48 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  31.76 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  38.2 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  34.01 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  32.37 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  32.09 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  30.94 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  28.1 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.74 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  25.43 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1597  hypothetical protein  63.83 
 
 		 78 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  28.57 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.55 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  40.22 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  35.97 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  30 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  30.23 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  25.77 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.91 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  32.63 
 
 		 789 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  37.78 
 
 		 171 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>