More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2627  ATPase  53.26 
 
 
865 aa  854    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  43.19 
 
 
873 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  56.84 
 
 
887 aa  912    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  48.81 
 
 
875 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  45.31 
 
 
880 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  53.04 
 
 
878 aa  853    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  50.88 
 
 
909 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  53.02 
 
 
865 aa  868    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  52.95 
 
 
905 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  62.61 
 
 
928 aa  1014    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  43.71 
 
 
867 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  46.42 
 
 
882 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  46.95 
 
 
866 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  54.14 
 
 
897 aa  853    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  66.67 
 
 
884 aa  1110    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  51.89 
 
 
867 aa  842    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  51.35 
 
 
899 aa  823    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  53.84 
 
 
889 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  51.11 
 
 
898 aa  788    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  54.51 
 
 
889 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  46.4 
 
 
913 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  66.29 
 
 
887 aa  1103    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  53.84 
 
 
865 aa  888    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.73 
 
 
887 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  44.85 
 
 
867 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  54.51 
 
 
889 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  67 
 
 
888 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  57.86 
 
 
918 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  50.84 
 
 
846 aa  716    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  45.97 
 
 
885 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  56.16 
 
 
889 aa  873    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  46.75 
 
 
899 aa  692    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  54.61 
 
 
889 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  56.31 
 
 
893 aa  888    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  65.91 
 
 
887 aa  1088    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  57.98 
 
 
895 aa  917    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  66.78 
 
 
884 aa  1110    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  67 
 
 
888 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  50.4 
 
 
878 aa  686    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  54.39 
 
 
885 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  60.78 
 
 
901 aa  980    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  44.85 
 
 
862 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  57.08 
 
 
918 aa  918    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  67.65 
 
 
885 aa  1112    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  53.78 
 
 
879 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  53.75 
 
 
879 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  54.24 
 
 
887 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  45.65 
 
 
880 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  54.17 
 
 
891 aa  902    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  47.53 
 
 
902 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.1 
 
 
910 aa  799    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  47.28 
 
 
897 aa  790    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  45.42 
 
 
880 aa  697    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  56.05 
 
 
916 aa  871    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  57.86 
 
 
895 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  51.72 
 
 
849 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  54.39 
 
 
885 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  60.13 
 
 
902 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  51.74 
 
 
889 aa  819    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  54.51 
 
 
889 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  45.61 
 
 
893 aa  661    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  61.54 
 
 
916 aa  1045    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  58.03 
 
 
889 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  48.56 
 
 
875 aa  665    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  45.06 
 
 
884 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  53.88 
 
 
889 aa  844    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  59.21 
 
 
681 aa  741    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  44.06 
 
 
869 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  44.41 
 
 
882 aa  690    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  43.07 
 
 
872 aa  696    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  48.74 
 
 
868 aa  805    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  44.22 
 
 
863 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  52.55 
 
 
882 aa  835    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  53.95 
 
 
889 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  58.97 
 
 
897 aa  895    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  60.33 
 
 
902 aa  1049    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  52.08 
 
 
849 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  50.13 
 
 
877 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  56.39 
 
 
906 aa  881    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  53.95 
 
 
889 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  53.96 
 
 
889 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  43.19 
 
 
894 aa  695    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  58.58 
 
 
915 aa  884    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  54.51 
 
 
889 aa  859    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  53.78 
 
 
879 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  56.72 
 
 
893 aa  867    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  44.72 
 
 
882 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  46.23 
 
 
881 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  42.69 
 
 
895 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  45.85 
 
 
884 aa  721    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  59.49 
 
 
925 aa  1014    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  54.73 
 
 
906 aa  879    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  66.67 
 
 
884 aa  1110    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  54.14 
 
 
897 aa  853    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  67 
 
 
888 aa  1121    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  60.49 
 
 
900 aa  1035    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.6 
 
 
891 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  66.67 
 
 
884 aa  1108    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  56.17 
 
 
889 aa  891    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  54.51 
 
 
889 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>