144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25810  nuclease  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  45.32 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  46.92 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  45.31 
 
 		 225 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  39.84 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  40.46 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  39.16 
 
 		 232 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  41.79 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  42.54 
 
 		 153 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  39.84 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  39.84 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.69 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  38.89 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  37.68 
 
 		 206 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  37.01 
 
 		 228 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  37.98 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  42.5 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  36.72 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.17 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.78 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  37.93 
 
 		 185 aa  84  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.97 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  38.52 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  38.85 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.84 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.5 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  38.81 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40.65 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.82 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.4 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.46 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  40.32 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  38.69 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  36.36 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  41.09 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.4 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.43 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  40.62 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.5 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  36.3 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  40.45 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.78 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.29 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  34.59 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.56 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.72 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.81 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  36.57 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.73 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  40.43 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.37 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  39.2 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  36.84 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.83 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  37.24 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.88 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.08 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  33.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.15 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  37.89 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.61 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  35.86 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.04 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.89 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.8 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.43 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.65 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  36.17 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.43 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  34.29 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  34.53 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  33.33 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  32.35 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  26.45 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  32.68 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  35.2 
 
 		 282 aa  52  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.76 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  33.09 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.43 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.13 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  34.11 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  35.38 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.47 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.47 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.07 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.47 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  35.83 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.25 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  30.13 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  31.71 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  32.54 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>