23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25380 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  52.56 
 
 		 828 aa  816    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  72.12 
 
 		 830 aa  1177    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  63.44 
 
 		 816 aa  1034    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  100 
 
 		 825 aa  1664    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  37.18 
 
 		 818 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  35.38 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  33.37 
 
 		 770 aa  351  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  39.74 
 
 		 773 aa  280  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  27.66 
 
 		 926 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  25.85 
 
 		 818 aa  171  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  30.39 
 
 		 1137 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  29.95 
 
 		 1171 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  28.54 
 
 		 1107 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  23.64 
 
 		 1056 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  27 
 
 		 954 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  27.43 
 
 		 978 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  26.28 
 
 		 1153 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  28.86 
 
 		 818 aa  74.3  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  36.36 
 
 		 1101 aa  64.7  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  24.56 
 
 		 1383 aa  63.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  24.94 
 
 		 1320 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1142 aa  45.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>