241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  100 
 
 
222 aa  434  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  53.57 
 
 
225 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  52.91 
 
 
224 aa  231  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  55 
 
 
224 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  55.61 
 
 
223 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  56 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  56 
 
 
228 aa  221  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  56.65 
 
 
231 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  56.65 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  56.65 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  56.16 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  56.16 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  56.16 
 
 
231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  55.5 
 
 
225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  55.67 
 
 
231 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  55.67 
 
 
231 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  55.67 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  49.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  49.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  49.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  49.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  49.77 
 
 
232 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  48.1 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  51.52 
 
 
225 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  51.2 
 
 
235 aa  191  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  43.38 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  40.43 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  41.7 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  42.92 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  42.57 
 
 
226 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  36.61 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  42.27 
 
 
215 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  42.27 
 
 
215 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  39.09 
 
 
222 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 
248 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 
248 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  41.62 
 
 
229 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  40.7 
 
 
248 aa  134  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  40.46 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  40.46 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  42.56 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  39.29 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  40.46 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  38.59 
 
 
248 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  40.24 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  39.77 
 
 
248 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  40.24 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  40.24 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  40.24 
 
 
277 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  38.33 
 
 
247 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  39.88 
 
 
278 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  41.71 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  41.84 
 
 
223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3071  flagellar hook capping protein  43.53 
 
 
217 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.113202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  36.04 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  37.95 
 
 
220 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  36.97 
 
 
227 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2732  flagellar hook capping protein  44.3 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000455072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  41.53 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  36.04 
 
 
245 aa  125  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  41.56 
 
 
240 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  40.26 
 
 
240 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  36.54 
 
 
234 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.82 
 
 
221 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  35.86 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  33.49 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  35.61 
 
 
235 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
235 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  32 
 
 
225 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  37.44 
 
 
216 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0928  flagellar hook capping protein  34.55 
 
 
223 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01288  flagellar basal body rod modification protein  32.29 
 
 
235 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 
222 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3102  flagellar hook capping protein  39.76 
 
 
216 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3829  flagellar hook capping protein  39.16 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  36.53 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  35.62 
 
 
230 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1226  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1226  flagellar basal body rod modification protein  32.99 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.07 
 
 
221 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2336  flagellar basal body rod modification protein  32 
 
 
236 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  33.18 
 
 
226 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
233 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  34.36 
 
 
233 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  33.16 
 
 
229 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  36.05 
 
 
221 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  35.9 
 
 
227 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  36.05 
 
 
221 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.09 
 
 
229 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  32.64 
 
 
222 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1479  basal-body rod modification protein FlgD  32.29 
 
 
256 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
221 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  32.64 
 
 
242 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  34.97 
 
 
221 aa  99  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0081  flagellar scaffolding protein FlgD  39.44 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3571  flagellar hook capping protein  35.1 
 
 
224 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  31.44 
 
 
293 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1717  flagellar hook capping protein  38.73 
 
 
223 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  30.24 
 
 
260 aa  95.5  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>