236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  100 
 
 
443 aa  904  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  56.92 
 
 
445 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  57.24 
 
 
439 aa  471  1e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  53.14 
 
 
457 aa  460  1e-128  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  56.12 
 
 
442 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  51.85 
 
 
460 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  52.69 
 
 
443 aa  445  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  52.05 
 
 
439 aa  448  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  52.2 
 
 
441 aa  446  1e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  51.52 
 
 
463 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  50.44 
 
 
440 aa  439  1e-122  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  51.34 
 
 
437 aa  441  1e-122  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  51.74 
 
 
439 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  50.55 
 
 
447 aa  417  1e-115  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  47.78 
 
 
442 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  47.1 
 
 
456 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  47.31 
 
 
443 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.67 
 
 
422 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  44.23 
 
 
444 aa  329  5e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  44.1 
 
 
442 aa  326  4e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4978  outer membrane porin  42.67 
 
 
443 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  6.30026e-06  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  42.79 
 
 
427 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  43.29 
 
 
446 aa  325  8e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  41.96 
 
 
427 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4878  outer membrane porin  41.56 
 
 
448 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.477958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  42.69 
 
 
429 aa  315  2e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  39.65 
 
 
421 aa  314  2e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  39.43 
 
 
421 aa  313  5e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3341  outer membrane porin  45.25 
 
 
437 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.66 
 
 
429 aa  303  4e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5318  outer membrane porin, OprD family  40.64 
 
 
448 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43.12 
 
 
429 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41.51 
 
 
417 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  42.89 
 
 
429 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  41.28 
 
 
417 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  43.08 
 
 
416 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  8.11517e-08 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.94 
 
 
417 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40.27 
 
 
418 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  40.23 
 
 
433 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  3.30448e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  39.77 
 
 
433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  39.28 
 
 
421 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  39.54 
 
 
429 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  40.63 
 
 
417 aa  287  3e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  40.77 
 
 
410 aa  287  3e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  39.54 
 
 
433 aa  287  3e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  40.63 
 
 
410 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  40.63 
 
 
410 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4465  porin, putative  40.35 
 
 
450 aa  285  1e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  39.24 
 
 
412 aa  282  7e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  39.5 
 
 
415 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  39.16 
 
 
421 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  38.65 
 
 
423 aa  276  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.42 
 
 
433 aa  273  5e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  38.63 
 
 
417 aa  273  5e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  39.73 
 
 
416 aa  273  5e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  40 
 
 
416 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  38.84 
 
 
408 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  38.38 
 
 
427 aa  270  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.13 
 
 
418 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.34 
 
 
440 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  40.76 
 
 
418 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  38.85 
 
 
423 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  38.67 
 
 
416 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.05785e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  38.85 
 
 
423 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  37.95 
 
 
408 aa  263  5e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.73 
 
 
420 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.86 
 
 
411 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.72 
 
 
431 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  37.72 
 
 
431 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.36 
 
 
420 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  37 
 
 
440 aa  254  2e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  39.46 
 
 
409 aa  254  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  40.55 
 
 
416 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  39.46 
 
 
409 aa  253  4e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.65 
 
 
424 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  37.36 
 
 
412 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  35.68 
 
 
418 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.04 
 
 
430 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  36.07 
 
 
418 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  35.57 
 
 
427 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  37.98 
 
 
416 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  35.59 
 
 
419 aa  249  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  35.9 
 
 
424 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  39.17 
 
 
416 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  38.94 
 
 
416 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  35.43 
 
 
423 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  36.11 
 
 
422 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.28 
 
 
417 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  36.67 
 
 
412 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  36.59 
 
 
417 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  36.9 
 
 
415 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  36.67 
 
 
412 aa  245  1e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  35.76 
 
 
412 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  34.8 
 
 
418 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  38.43 
 
 
416 aa  240  3e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.36 
 
 
418 aa  239  7e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  35.99 
 
 
410 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  37.04 
 
 
431 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.35 
 
 
426 aa  236  5e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  34.15 
 
 
418 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>