More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_21680  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  66.42 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3600  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  66.05 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326456  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2539  LysR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 296 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3227  LysR family transcriptional regulator  61.85 
 
 		 296 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30980  Transcriptional regulator LysR family protein  62.59 
 
 		 303 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30450  LysR family transcriptional regulator  58.52 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1550  transcriptional regulator, LysR family  56.92 
 
 		 303 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.93213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4332  LysR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 322 aa  248  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  0.192569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1753  LysR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0990804  normal  0.117746 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4155  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 307 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532001  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4108  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 324 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4258  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 324 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000322275  normal  0.291144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3259  LysR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3682  LysR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 326 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1243  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 316 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1913  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5230  LysR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 212 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957267  normal  0.114688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3859  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000387155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0027  transcriptional regulatory protein  39.71 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000739069  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3798  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 312 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0310  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3119  transcriptional regulatory protein  39.62 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0213  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718825  unclonable  0.0000000000104245 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  42.57 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  42.57 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4028  LysR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  42.57 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2780  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.967057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2877  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2114  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  28.09 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5637  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  23.94 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  22.88 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.77 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.64 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3382  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  24.12 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3761  redox-sensitive transcriptional activator OxyR  25.51 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0863  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.267188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.73 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0002  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1833  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  25.59 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1120  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.359729  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  23.11 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1449  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1184  transcriptional regulator  25.91 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  26.56 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  26.75 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.34 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  26.03 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>